21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1451 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1451  hypothetical protein  100 
 
 
91 aa  181  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00482298 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1580  NifZ family protein  58.14 
 
 
103 aa  101  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.854887 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5898  hypothetical protein  57.69 
 
 
82 aa  84.7  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00590287  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4467  NifZ  59.46 
 
 
76 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0117  NifZ family protein  50 
 
 
81 aa  82  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.788219 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3640  NifZ family protein  59.15 
 
 
79 aa  81.6  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.231555 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1069  hypothetical protein  48.78 
 
 
85 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0965  NifZ  58.11 
 
 
85 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.201713  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0402  NifZ family protein  52.7 
 
 
82 aa  80.1  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5105  NifZ family protein  54.05 
 
 
77 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1410  NifZ protein, putative  52.86 
 
 
92 aa  73.2  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0210  nifZ protein, putative  48 
 
 
89 aa  68.9  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.000650031  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1536  NifZ domain protein  45.21 
 
 
83 aa  63.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1252  NifZ family protein  45.21 
 
 
84 aa  63.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355595  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7746  hypothetical protein  56.25 
 
 
113 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3957  NifZ  33.33 
 
 
95 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000304465  hitchhiker  0.00212617 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1579  NifZ family protein  31.4 
 
 
120 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.654864 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2128  NifZ family protein  35.21 
 
 
88 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.560071 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4243  NifZ  30.99 
 
 
88 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1371  NifZ family protein  31.94 
 
 
95 aa  41.6  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0947  NifZ family protein  31.51 
 
 
82 aa  40.4  0.009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0285448  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>