More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0138 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_0138  ABC transporter related  100 
 
 
276 aa  560  1.0000000000000001e-159  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3990  ABC transporter related  92.75 
 
 
276 aa  529  1e-149  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3738  ABC transporter related  76.09 
 
 
276 aa  435  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0710924  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3368  ABC transporter related  61.68 
 
 
297 aa  355  3.9999999999999996e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4041  ABC transporter related protein  61.31 
 
 
295 aa  350  2e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3864  ABC transporter related  60.95 
 
 
295 aa  348  6e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3534  ABC transporter related  61.68 
 
 
295 aa  340  2e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.463988 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0035  ABC transporter related  57.09 
 
 
285 aa  338  8e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00363386  normal  0.320006 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1251  ABC transporter related  58.18 
 
 
284 aa  335  5e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1903  ABC transporter related  59.34 
 
 
277 aa  334  1e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264494  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4177  ABC transporter related  59.56 
 
 
277 aa  333  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3849  ABC transporter related  59.93 
 
 
277 aa  332  4e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.997638 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2323  ABC transporter related  60.29 
 
 
277 aa  330  1e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.936398 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3885  ABC transporter  61.03 
 
 
277 aa  330  1e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1882  ABC transporter related  57.2 
 
 
279 aa  329  3e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.573524  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0375  ABC transporter related  60.29 
 
 
274 aa  329  3e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.157561  normal  0.579699 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2462  ABC transporter related  59.93 
 
 
274 aa  329  3e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.612548  normal  0.124723 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5170  ABC transporter related  59.21 
 
 
285 aa  329  4e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.219608  normal  0.319827 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5439  ABC transporter related  58.39 
 
 
285 aa  326  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.476246  hitchhiker  0.0038839 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0804  ABC dipeptide transporter, ATPase subunit DppD  59.56 
 
 
274 aa  326  2.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.69273  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2703  ABC transporter related  56.25 
 
 
287 aa  323  3e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3251  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  57.25 
 
 
279 aa  321  6e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0275021  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1027  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  57.09 
 
 
291 aa  322  6e-87  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.26315  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2717  ABC transporter related  56.99 
 
 
279 aa  317  9e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3091  ABC transporter related  56.99 
 
 
287 aa  317  1e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1920  ABC transporter component  58.09 
 
 
276 aa  315  4e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.2221  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3832  ABC transporter related  57.14 
 
 
280 aa  308  5e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4053  ABC transporter related  56.36 
 
 
301 aa  298  6e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.149041  normal  0.435082 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4007  ABC transporter related  55.96 
 
 
297 aa  298  6e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7647  ABC transporter related  56 
 
 
291 aa  292  3e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1250  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  56 
 
 
304 aa  290  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.544036  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4020  ABC transporter related  55.4 
 
 
304 aa  290  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.732506  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4482  ABC transporter related  55.04 
 
 
304 aa  289  3e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.959295 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6304  ABC transporter related  54.91 
 
 
292 aa  289  4e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5711  ABC transporter related  55.04 
 
 
304 aa  289  4e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0661262 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3774  ABC transporter related  55.04 
 
 
304 aa  289  4e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4594  ABC transporter related  55.04 
 
 
304 aa  289  4e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.254879  normal  0.570129 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0194  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  54.18 
 
 
296 aa  287  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0233708 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2043  ABC transporter related  52.73 
 
 
276 aa  286  2.9999999999999996e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.336265  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1445  ABC transporter, ATP-binding protein  56 
 
 
293 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3201  ABC transporter related  52.75 
 
 
291 aa  280  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.776015  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1308  ABC transporter, ATP-binding protein  56 
 
 
293 aa  278  5e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0652042  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1277  ABC transporter, ATP-binding protein  55.64 
 
 
293 aa  277  1e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.846067  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1389  ABC transporter, ATP-binding protein  55.64 
 
 
293 aa  277  1e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0826888  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1047  ABC transporter, ATP-binding protein  55.64 
 
 
293 aa  277  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0250  ABC transporter, ATP-binding protein  55.64 
 
 
293 aa  277  1e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0521  ABC transporter, ATP-binding protein  55.64 
 
 
293 aa  277  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.939776  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2558  ABC transporter, ATP-binding protein  55.64 
 
 
293 aa  276  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0802  ABC transporter component  51.15 
 
 
276 aa  265  8e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.051347  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1881  ABC transporter related  52.61 
 
 
281 aa  261  6e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176759  normal  0.192809 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1695  ABC transporter related  55.42 
 
 
286 aa  259  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.930247  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2059  ABC transporter related  48.13 
 
 
283 aa  256  2e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.113348  normal  0.75932 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5352  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  50.37 
 
 
350 aa  252  5.000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1778  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.63 
 
 
320 aa  248  7e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000196447 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0869  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like protein  51.31 
 
 
343 aa  248  9e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2439  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.63 
 
 
320 aa  248  1e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0907  putative ATP-binding component of dipeptide transport system  46.84 
 
 
318 aa  246  3e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000823752  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4105  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  47.25 
 
 
347 aa  246  4e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0759  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.43 
 
 
353 aa  245  4.9999999999999997e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1303  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  46.89 
 
 
347 aa  245  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.92932  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1237  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  46.89 
 
 
347 aa  245  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.180341  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1341  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  46.89 
 
 
347 aa  245  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000765858  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1104  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  46.89 
 
 
347 aa  244  8e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1086  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  46.89 
 
 
347 aa  244  8e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4234  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  48.52 
 
 
338 aa  244  8e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1080  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  46.89 
 
 
347 aa  244  8e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1194  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  46.89 
 
 
347 aa  244  8e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.118138  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1264  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  46.89 
 
 
347 aa  244  8e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4611  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  48.52 
 
 
338 aa  244  8e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4393  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  48.15 
 
 
338 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1615  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.62 
 
 
353 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4246  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  48.52 
 
 
338 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4733  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  48.15 
 
 
338 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2052  peptide ABC transporter ATP-binding protein  51.95 
 
 
343 aa  244  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.618151 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0111  dipeptide transporter ATP-binding subunit  49.25 
 
 
322 aa  244  9.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1092  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.52 
 
 
347 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00314713  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2913  ABC transporter-related protein  50 
 
 
278 aa  243  3e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0899  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.89 
 
 
347 aa  243  3e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.61652  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0487  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  51.95 
 
 
340 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3821  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.83 
 
 
332 aa  243  3.9999999999999997e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.282595  normal  0.751344 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0259  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.35 
 
 
325 aa  241  7.999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0091  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.62 
 
 
325 aa  240  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1712  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.88 
 
 
320 aa  240  2e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000540803  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1319  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  48.84 
 
 
658 aa  239  2.9999999999999997e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.179908  normal  0.0765459 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2814  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  51.17 
 
 
340 aa  239  4e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.241348  normal  0.0563642 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2723  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  51.54 
 
 
324 aa  239  4e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal  0.451475 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0452  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.85 
 
 
332 aa  239  4e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2573  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  49.22 
 
 
333 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.194756  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1079  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  50.97 
 
 
345 aa  238  6.999999999999999e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.233153  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2969  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  48.2 
 
 
341 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0804764  normal  0.623944 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2264  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  49.22 
 
 
333 aa  237  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0319063  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2755  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.72 
 
 
327 aa  236  2e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4686  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  51.14 
 
 
338 aa  236  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1864  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.06 
 
 
350 aa  236  4e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.429685  normal  0.131227 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1016  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.86 
 
 
662 aa  236  4e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2359  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  47.39 
 
 
342 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0806  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.93 
 
 
330 aa  235  5.0000000000000005e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0272  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  47.66 
 
 
319 aa  235  6e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5668  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.92 
 
 
342 aa  235  7e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.467741  normal  0.0318296 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4792  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50.76 
 
 
338 aa  235  7e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.312785  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>