28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2566 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2566  hypothetical protein  100 
 
 		 617 aa  1208    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1117  beta strand repeat-containing protein  33.7 
 
 		 422 aa  84  0.000000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0614  parallel beta-helix repeat-containing protein  37.84 
 
 		 36805 aa  58.5  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0046  putative serine protease  41.57 
 
 		 1066 aa  55.1  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000707412  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1718  hypothetical protein  26.17 
 
 		 582 aa  54.3  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.053608  normal  0.169106 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4300  Outer membrane autotransporter barrel  41.33 
 
 		 987 aa  54.3  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.359518 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2542  hypothetical protein  85.71 
 
 		 225 aa  52.8  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1857  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.58 
 
 		 1322 aa  49.7  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000638249 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0264  beta strand repeat-containing protein  24.36 
 
 		 860 aa  49.7  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1203  outer membrane autotransporter  29.96 
 
 		 1769 aa  48.9  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25101  hypothetical protein  36.45 
 
 		 669 aa  48.9  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  39.33 
 
 		 983 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6464  outer membrane autotransporter  29.8 
 
 		 1459 aa  48.5  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3549  outer membrane autotransporter barrel domain protein  39.77 
 
 		 1125 aa  48.1  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0132  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.41 
 
 		 972 aa  47.4  0.0008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  32.56 
 
 		 1028 aa  47.4  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  0.0000368637 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6171  outer membrane autotransporter  29.14 
 
 		 1458 aa  46.6  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1031  outer membrane autotransporter  29.41 
 
 		 1172 aa  47  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0914454  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19271  hypothetical protein  36.11 
 
 		 693 aa  47  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.381808 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  34.43 
 
 		 1033 aa  45.8  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1881  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.64 
 
 		 1532 aa  46.2  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  31.02 
 
 		 1004 aa  45.8  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  32.23 
 
 		 1001 aa  45.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3929  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.14 
 
 		 1011 aa  45.1  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19291  hypothetical protein  32.85 
 
 		 479 aa  45.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2455  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.63 
 
 		 919 aa  44.3  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739869  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1573  ribose-5-phosphate isomerase A  25.7 
 
 		 231 aa  43.9  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0689675  normal  0.86035 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2115  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.98 
 
 		 1694 aa  43.9  0.01  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0846995  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>