24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2524 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2524  hypothetical protein  100 
 
 
86 aa  175  2e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2747  hypothetical protein  83.54 
 
 
90 aa  139  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.123898  normal  0.85642 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0084  hypothetical protein  84.62 
 
 
89 aa  137  7e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0077  hypothetical protein  82.05 
 
 
89 aa  134  3.0000000000000003e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0411  CopG family protein  70.51 
 
 
77 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0451  CopG family protein  62.5 
 
 
87 aa  108  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.14653  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1724  CopG family protein  64.56 
 
 
78 aa  105  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.142369  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0070  CopG family protein  60.53 
 
 
75 aa  102  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2830  helix-turn-helix protein, CopG family  55.7 
 
 
79 aa  98.6  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0621  hypothetical protein  58.33 
 
 
75 aa  97.1  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.206536  normal  0.792782 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0580  hypothetical protein  63.89 
 
 
74 aa  96.7  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0606  hypothetical protein  56.94 
 
 
75 aa  94  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1716  helix-turn-helix protein, CopG family  56.58 
 
 
75 aa  91.3  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0696  hypothetical protein  50.68 
 
 
81 aa  89.4  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0101984  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1640  hypothetical protein, putative phage gene  62.03 
 
 
81 aa  88.2  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0227  hypothetical protein  52.24 
 
 
84 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.127505  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0446  hypothetical protein  47.56 
 
 
88 aa  77.8  0.00000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000515088  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1718  CopG family protein  49.28 
 
 
75 aa  75.1  0.0000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1495  CopG family protein  46.15 
 
 
80 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.328754 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2001  CopG family protein  41.56 
 
 
85 aa  69.3  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.322233  hitchhiker  0.000000165214 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1779  helix-turn-helix protein, CopG family  38.89 
 
 
82 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.44193 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0434  putative toxin-antitoxin system, antitoxin component, ribbon-helix-helix domain protein  30.26 
 
 
87 aa  51.2  0.000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000128603 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06670  hypothetical protein  42.86 
 
 
69 aa  48.5  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00382876  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1133  hypothetical protein  28.79 
 
 
94 aa  44.7  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.018693  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>