30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2113 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2113  Methyltransferase type 12  100 
 
 
240 aa  485  1e-136  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.294106  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1026  Methyltransferase type 11  30.59 
 
 
235 aa  96.3  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3234  Methyltransferase type 11  30.59 
 
 
235 aa  93.2  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18910  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  31.98 
 
 
268 aa  87.8  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.07476  normal  0.315555 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1686  SAM-dependent methyltransferase  24.59 
 
 
263 aa  85.5  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0634865 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2728  SAM-dependent methyltransferase  26.4 
 
 
252 aa  83.2  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3186  Methyltransferase type 12  28.02 
 
 
245 aa  80.9  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.458893  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1938  hypothetical protein  32.5 
 
 
232 aa  80.1  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000329837 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0254  methyltransferase type 11  27.27 
 
 
230 aa  76.6  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.753586 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04540  hypothetical protein  28.44 
 
 
237 aa  75.5  0.0000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2534  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  29.07 
 
 
241 aa  74.7  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.115173 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10913  hypothetical protein  23.21 
 
 
236 aa  73.9  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127289  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3795  SAM-dependent methyltransferase  27.08 
 
 
230 aa  74.3  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.200041 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0419  hypothetical protein  26.96 
 
 
230 aa  72  0.000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.271566 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1513  hypothetical protein  28.45 
 
 
221 aa  72  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296421  normal  0.422698 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3807  methyltransferase type 12  22.77 
 
 
237 aa  70.1  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2036  Methyltransferase type 12  27.05 
 
 
231 aa  65.9  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.916897  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4711  methyltransferase type 12  28.75 
 
 
217 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5034  Methyltransferase type 12  24.24 
 
 
237 aa  60.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.244151 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1092  methyltransferase type 11  28.1 
 
 
224 aa  59.3  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1187  methyltransferase type 12  29.03 
 
 
236 aa  59.3  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.683233 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18721  hypothetical protein  27.15 
 
 
239 aa  59.3  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.377095 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1341  hypothetical protein  24.39 
 
 
238 aa  57.4  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3390  hypothetical protein  30 
 
 
239 aa  55.1  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2197  hypothetical protein  31.31 
 
 
243 aa  52.4  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.123697  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2675  hypothetical protein  29.8 
 
 
253 aa  52  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2808  hypothetical protein  29.81 
 
 
248 aa  49.3  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0677099  normal  0.911187 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0083  Methyltransferase type 11  32.84 
 
 
250 aa  44.7  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0315  hypothetical protein  27.19 
 
 
223 aa  45.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0502  Methyltransferase type 12  23.61 
 
 
299 aa  42.4  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.510695 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>