21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0739 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0739  hypothetical protein  100 
 
 
226 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3965  hypothetical protein  51.29 
 
 
230 aa  228  5e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2239  hypothetical protein  49.57 
 
 
226 aa  207  8e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000870146  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5615  hypothetical protein  44.68 
 
 
217 aa  188  5.999999999999999e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.90828  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5163  hypothetical protein  43.3 
 
 
218 aa  185  5e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3197  hypothetical protein  39.26 
 
 
233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1771  hypothetical protein  44.1 
 
 
212 aa  162  3e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.9978  normal  0.0273818 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1805  hypothetical protein  37.66 
 
 
228 aa  134  9e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30990  hypothetical protein  33.18 
 
 
222 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000727395  unclonable  3.33317e-22 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0272  hypothetical protein  28.89 
 
 
215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1347  hypothetical protein  31.28 
 
 
189 aa  109  4.0000000000000004e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.151011  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2669  hypothetical protein  31.53 
 
 
214 aa  108  6e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1929  hypothetical protein  29.95 
 
 
233 aa  108  6e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4861  hypothetical protein  31.73 
 
 
179 aa  107  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.967207  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3993  hypothetical protein  30.48 
 
 
177 aa  103  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3574  hypothetical protein  29.2 
 
 
202 aa  102  6e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00303  hypothetical protein  29.95 
 
 
170 aa  99  5e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.316829  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2520  hypothetical protein  29.47 
 
 
173 aa  99  6e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2952  hypothetical protein  31.07 
 
 
208 aa  96.7  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4382  hypothetical protein  28.1 
 
 
176 aa  93.6  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.12539 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3558  hypothetical protein  30.67 
 
 
203 aa  92.8  4e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>