More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0266 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0266  phosphoribosylamine/glycine ligase  100 
 
 		 424 aa  872    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0221  phosphoribosylamine/glycine ligase  61.94 
 
 		 427 aa  537  1e-151  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.529077 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1722  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.99 
 
 		 425 aa  530  1e-149  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3458  phosphoribosylamine--glycine ligase  62.88 
 
 		 423 aa  521  1e-146  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2453  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.14 
 
 		 424 aa  520  1e-146  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.386914  normal  0.350843 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2323  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.72 
 
 		 429 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.125717  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3219  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.17 
 
 		 429 aa  436  1e-121  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.708681 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2231  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.12 
 
 		 423 aa  434  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3845  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.88 
 
 		 423 aa  434  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000183828  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2759  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.88 
 
 		 424 aa  429  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000179977  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0909  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.52 
 
 		 432 aa  430  1e-119  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2904  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.88 
 
 		 423 aa  427  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000288348  normal  0.785686 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0292  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.7 
 
 		 427 aa  426  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00181025  normal  0.0133648 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1777  phosphoribosylamine/glycine ligase  50.7 
 
 		 428 aa  426  1e-118  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0610  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.65 
 
 		 423 aa  424  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00101284  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3451  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.47 
 
 		 428 aa  422  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264337  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0224  phosphoribosylamine--glycine ligase  50 
 
 		 428 aa  420  1e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0267401  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1699  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.59 
 
 		 427 aa  419  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251383  normal  0.989876 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0464  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.88 
 
 		 428 aa  415  9.999999999999999e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00032027  normal  0.0111484 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0356  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.88 
 
 		 428 aa  416  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0104682  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03941  Phosphoribosylamine-glycine ligase  49.3 
 
 		 430 aa  416  9.999999999999999e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00211  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.3 
 
 		 429 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3844  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.88 
 
 		 428 aa  415  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000315171  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0228  phosphoribosylamine--glycine ligase  50 
 
 		 428 aa  417  9.999999999999999e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0316556  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2591  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.65 
 
 		 423 aa  416  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002184  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.06 
 
 		 429 aa  413  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.25624  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0960  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.7 
 
 		 426 aa  414  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3708  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.77 
 
 		 428 aa  412  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0202463  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1245  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.26 
 
 		 419 aa  413  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.495633  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3465  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.64 
 
 		 456 aa  413  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3457  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.29 
 
 		 423 aa  415  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.021302  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3862  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.77 
 
 		 429 aa  409  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.256361  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2863  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.88 
 
 		 426 aa  410  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0385682  normal  0.548732 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2652  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.53 
 
 		 429 aa  411  1e-113  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0438  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.48 
 
 		 430 aa  408  1e-113  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.199076  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1863  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.94 
 
 		 442 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.466784  hitchhiker  0.0074915 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0805  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.53 
 
 		 430 aa  409  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3523  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.58 
 
 		 423 aa  409  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0437232 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2361  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.11 
 
 		 422 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1427  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.81 
 
 		 591 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4548  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.95 
 
 		 429 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000304372  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4020  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.95 
 
 		 429 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000927217  normal  0.0101467 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3406  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.47 
 
 		 432 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.586038  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4104  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.99 
 
 		 427 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0266  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.83 
 
 		 427 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000213794  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03882  phosphoribosylamine-glycine ligase  48.95 
 
 		 429 aa  404  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000860274  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03835  hypothetical protein  48.95 
 
 		 429 aa  404  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000931477  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1353  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.99 
 
 		 427 aa  405  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.2506  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4407  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.59 
 
 		 431 aa  402  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.357121 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4386  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.71 
 
 		 429 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.677738 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4453  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.71 
 
 		 429 aa  401  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  hitchhiker  0.000392069 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2552  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.17 
 
 		 426 aa  402  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0177333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0215  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.95 
 
 		 430 aa  402  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0406099  normal  0.0125796 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5474  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.48 
 
 		 429 aa  404  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4239  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.71 
 
 		 429 aa  404  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00124381  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0535  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.23 
 
 		 427 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.201111 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0578  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.46 
 
 		 425 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0529  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.58 
 
 		 429 aa  402  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.863272  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3988  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.24 
 
 		 429 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0361396  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4496  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.24 
 
 		 429 aa  399  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000225394  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4419  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.24 
 
 		 429 aa  401  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.160091  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4582  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.01 
 
 		 429 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.213422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1626  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.74 
 
 		 432 aa  399  9.999999999999999e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2180  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.78 
 
 		 419 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.900628  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4508  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.01 
 
 		 429 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0778373 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0392  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.04 
 
 		 424 aa  401  9.999999999999999e-111  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.423575  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4867  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.65 
 
 		 431 aa  396  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0434  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.76 
 
 		 424 aa  395  1e-109  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1753  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.76 
 
 		 437 aa  395  1e-109  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.528627  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2827  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.83 
 
 		 437 aa  397  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000587328  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0612  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.42 
 
 		 430 aa  398  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.147919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3149  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.53 
 
 		 433 aa  396  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.868678  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0172  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.24 
 
 		 429 aa  396  1e-109  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02964  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.01 
 
 		 429 aa  396  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4506  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.78 
 
 		 429 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0278032 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2843  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.01 
 
 		 430 aa  397  1e-109  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.294227  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0177  phosphoribosylamine/glycine ligase  46.6 
 
 		 429 aa  392  1e-108  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.348487  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4823  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.95 
 
 		 431 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0360  Phosphoribosylamine--glycine ligase  47.65 
 
 		 430 aa  392  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0264  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.65 
 
 		 430 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46971  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0619  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.17 
 
 		 427 aa  394  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.374111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3413  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.3 
 
 		 433 aa  392  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.872928 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0471  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.17 
 
 		 423 aa  393  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3871  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.53 
 
 		 435 aa  392  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.485049  normal  0.0530756 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2988  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.18 
 
 		 428 aa  392  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4613  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.18 
 
 		 431 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.302277 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4698  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.95 
 
 		 430 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.744432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4180  phosphoribosylamine/glycine ligase  49.77 
 
 		 435 aa  393  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.94163  normal  0.510323 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2342  phosphoribosylamine/glycine ligase  49.06 
 
 		 428 aa  394  1e-108  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.51337  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4876  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.95 
 
 		 431 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0555  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.07 
 
 		 431 aa  390  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0414  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.06 
 
 		 427 aa  389  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31965  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2043  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.76 
 
 		 421 aa  391  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.453314 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0719  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.65 
 
 		 426 aa  389  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.63678  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0422  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.06 
 
 		 427 aa  390  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23090  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.18 
 
 		 425 aa  389  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.121893  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0431  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.21 
 
 		 433 aa  385  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1480  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.93 
 
 		 419 aa  387  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0526  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.36 
 
 		 419 aa  385  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0707  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.71 
 
 		 429 aa  388  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>