More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_2023 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  65.84 
 
 		 445 aa  639    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3760  glutamine synthetase, type I  71.16 
 
 		 443 aa  669    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000185172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  69.79 
 
 		 444 aa  657    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  69.84 
 
 		 444 aa  640    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  70.16 
 
 		 443 aa  656    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1764  L-glutamine synthetase  69.7 
 
 		 442 aa  640    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2023  glutamine synthetase, type I  100 
 
 		 443 aa  922    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2807  glutamine synthetase, type I  69.68 
 
 		 444 aa  648    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0737852  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3759  glutamine synthetase, type I  75.68 
 
 		 444 aa  724    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000109487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2806  glutamine synthetase, type I  75 
 
 		 449 aa  712    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2270  L-glutamine synthetase  66.36 
 
 		 440 aa  629  1e-179  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.327087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2027  glutamine synthetase, type I  66.82 
 
 		 443 aa  624  1e-177  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.123659  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2178  glutamine synthetase, type I  67.5 
 
 		 444 aa  620  1e-176  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  65.62 
 
 		 445 aa  620  1e-176  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1007  glutamate--ammonia ligase  64.35 
 
 		 442 aa  602  1.0000000000000001e-171  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000328264  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  62.81 
 
 		 444 aa  591  1e-167  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2381  glutamine synthetase, type I  61.94 
 
 		 444 aa  585  1e-166  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3731  glutamine synthetase, type I  61.49 
 
 		 444 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3549  glutamine synthetase, type I  61.26 
 
 		 444 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3449  glutamine synthetase, type I  61.26 
 
 		 444 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3462  glutamate--ammonia ligase (glutamine synthetase, type I)  61.26 
 
 		 444 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  60.86 
 
 		 443 aa  583  1.0000000000000001e-165  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3833  glutamine synthetase, type I  61.26 
 
 		 444 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3754  glutamine synthetase, type I  61.49 
 
 		 444 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149768  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  61.9 
 
 		 444 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3713  glutamine synthetase, type I  61.26 
 
 		 444 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53476e-18 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1502  glutamine synthetase, type I  61.04 
 
 		 444 aa  578  1e-164  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0398754 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3469  glutamine synthetase, type I  61.26 
 
 		 444 aa  579  1e-164  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00616587  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3803  glutamine synthetase, type I  61.04 
 
 		 444 aa  578  1e-164  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  60.77 
 
 		 445 aa  577  1.0000000000000001e-163  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2490  glutamine synthetase, type I  62.19 
 
 		 446 aa  564  1.0000000000000001e-159  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.137457 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21290  glutamine synthetase, type I  59.04 
 
 		 441 aa  562  1.0000000000000001e-159  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0204015  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1368  glutamine synthetase, type I  58.5 
 
 		 446 aa  560  1e-158  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0431284  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1394  glutamine synthetase, type I  58.5 
 
 		 446 aa  560  1e-158  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.180794  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0952  L-glutamine synthetase  56.85 
 
 		 445 aa  553  1e-156  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00098496  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0876  glutamine synthetase FemC  57.14 
 
 		 446 aa  550  1e-155  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0666  L-glutamine synthetase  57.8 
 
 		 447 aa  550  1e-155  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.57633 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0994  glutamine synthetase, type I  56.06 
 
 		 442 aa  535  1e-151  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1204  glutamine synthetase, type I  60.32 
 
 		 452 aa  532  1e-150  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00014918  normal  0.349834 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1202  L-glutamine synthetase  53.39 
 
 		 447 aa  528  1e-149  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000336656  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1975  L-glutamine synthetase  56.69 
 
 		 442 aa  530  1e-149  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2711  glutamine synthetase, type I  57.75 
 
 		 442 aa  523  1e-147  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1763  glutamine synthetase, type I  56.56 
 
 		 448 aa  519  1e-146  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.484266  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0335  glutamine synthetase, type I  56.51 
 
 		 442 aa  518  1e-146  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0032404  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0717  L-glutamine synthetase  54.63 
 
 		 448 aa  516  1.0000000000000001e-145  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.837857  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3996  glutamine synthetase, type I  53.86 
 
 		 443 aa  509  1e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1751  glutamine synthetase  54.88 
 
 		 447 aa  509  1e-143  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0249  glutamine synthetase, type I  55.92 
 
 		 433 aa  508  1e-143  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.449889  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2648  glutamine synthetase type I  54.89 
 
 		 453 aa  511  1e-143  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000984867  normal  0.0179491 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1689  glutamine synthetase, type I  54.2 
 
 		 441 aa  507  9.999999999999999e-143  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.394056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1799  glutamine synthetase, type I  54.36 
 
 		 439 aa  504  9.999999999999999e-143  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.743478  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2135  glutamine synthetase, type I  55.81 
 
 		 442 aa  507  9.999999999999999e-143  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3763  glutamine synthetase, type I  55.33 
 
 		 457 aa  503  1e-141  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000243827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1837  glutamine synthetase, type I  55.56 
 
 		 439 aa  500  1e-140  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0779  glutamine synthetase, type I  55.81 
 
 		 443 aa  501  1e-140  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.110756  normal  0.217616 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2480  glutamine synthetase, type I  55.02 
 
 		 452 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2374  glutamine synthetase, type I  53.58 
 
 		 456 aa  485  1e-136  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.943832  normal  0.417951 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2512  L-glutamine synthetase  55.45 
 
 		 446 aa  484  1e-136  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5189  glutamine synthetase, type I  54.86 
 
 		 451 aa  482  1e-135  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0990  glutamine synthetase, type I  51.86 
 
 		 439 aa  483  1e-135  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0186691  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0952  L-glutamine synthetase  50.11 
 
 		 447 aa  482  1e-135  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.434592  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1537  glutamine synthetase, type I  54.73 
 
 		 456 aa  478  1e-134  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1435  glutamine synthetase, type I  53.21 
 
 		 437 aa  475  1e-133  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1379  glutamine synthetase  50.68 
 
 		 448 aa  475  1e-133  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000272727  hitchhiker  0.00000000000339738 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1459  glutamine synthetase, type I  56.01 
 
 		 451 aa  477  1e-133  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1260  L-glutamine synthetase  53.16 
 
 		 461 aa  476  1e-133  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1466  glutamine synthetase, type I  50.45 
 
 		 446 aa  471  1e-132  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3015  glutamine synthetase, type I  55.66 
 
 		 450 aa  470  1.0000000000000001e-131  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2099  glutamine synthetase, type I  52.14 
 
 		 447 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0634  glutamine synthetase, type I  51.25 
 
 		 444 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.144254  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0150  glutamine synthetase, type I  50.58 
 
 		 448 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.991128  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2273  glutamine synthetase, type I  48.76 
 
 		 443 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0952  L-glutamine synthetase  50.34 
 
 		 443 aa  465  9.999999999999999e-131  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0453  glutamine synthetase, type I  50.23 
 
 		 446 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0384  L-glutamine synthetase  49.55 
 
 		 446 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.882152  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1793  glutamine synthetase, type I  52.46 
 
 		 441 aa  462  1e-129  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0709  glutamine synthetase, type I  54.42 
 
 		 449 aa  464  1e-129  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.616816 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2389  glutamine synthetase, type I  50.11 
 
 		 448 aa  462  1e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000201555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0261  glutamine synthetase, type I  50.69 
 
 		 439 aa  462  1e-129  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00869904  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4032  glutamine synthetase, type I  52.85 
 
 		 444 aa  462  1e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0782216  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_941  glutamine synthetase, type I  50.8 
 
 		 443 aa  463  1e-129  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0009  glutamine synthetase, type I  52.14 
 
 		 447 aa  463  1e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0180  glutamine synthetase, type I  50.57 
 
 		 446 aa  461  1e-129  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1123  glutamine synthetase, type I  50.11 
 
 		 443 aa  459  9.999999999999999e-129  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.245157  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3382  glutamine synthetase, type I  54.14 
 
 		 451 aa  461  9.999999999999999e-129  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  51.03 
 
 		 450 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1125  L-glutamine synthetase  51.13 
 
 		 443 aa  455  1e-127  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0811977  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0521  glutamine synthetase, type I  49.66 
 
 		 446 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0104  L-glutamine synthetase  51.24 
 
 		 449 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4242  glutamine synthetase, type I  50.68 
 
 		 446 aa  448  1e-125  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.348488  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2819  glutamine synthetase, type I  47.53 
 
 		 448 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0770  glutamine synthetase, type I  48.4 
 
 		 450 aa  434  1e-120  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127283 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2810  glutamate--ammonia ligase  47.86 
 
 		 432 aa  419  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000780353  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3479  glutamine synthetase, type I  48.31 
 
 		 444 aa  420  1e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0194091  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0202  L-glutamine synthetase  46.79 
 
 		 440 aa  421  1e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1258  glutamine synthetase, type I  47.72 
 
 		 453 aa  412  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0380427 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1047  glutamine synthetase, type I  47.96 
 
 		 444 aa  413  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1700  glutamine synthetase, type I  47.67 
 
 		 445 aa  413  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07430  L-glutamine synthetase  46.99 
 
 		 447 aa  409  1e-113  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1766  glutamine synthetase catalytic region  47.14 
 
 		 452 aa  409  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.725397  decreased coverage  0.000162709 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>