More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0856 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0856  hypothetical protein  100 
 
 		 555 aa  1130    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1973  ABC-1 domain protein  39.26 
 
 		 547 aa  382  1e-105  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.921372  normal  0.103811 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0647  hypothetical protein  35.65 
 
 		 565 aa  347  2e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000186884  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2342  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  35.14 
 
 		 563 aa  339  9.999999999999999e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000602733  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1388  hypothetical protein  34.49 
 
 		 561 aa  327  3e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000298772  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1005  hypothetical protein  34.94 
 
 		 564 aa  325  9e-88  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0249187 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0760  2-octaprenylphenol hydroxylase  35.01 
 
 		 561 aa  322  8e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00151  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  33.94 
 
 		 558 aa  320  3.9999999999999996e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1088  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  34.24 
 
 		 561 aa  320  5e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0289446  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1648  2-octaprenylphenol hydroxylase  34.06 
 
 		 559 aa  316  6e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0902  ABC-1 domain protein  33.27 
 
 		 560 aa  316  9e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1871  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  33.63 
 
 		 568 aa  312  9e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2885  ABC-1 domain protein  33.04 
 
 		 582 aa  307  3e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3359  ABC-1 domain protein  32.49 
 
 		 560 aa  306  8.000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.779537 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1110  ABC-1 domain protein  34.06 
 
 		 599 aa  300  4e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0994  2-octaprenylphenol hydroxylase  34.04 
 
 		 559 aa  300  4e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.380493  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2578  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.63 
 
 		 559 aa  298  1e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152488  normal  0.0679255 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2561  ABC-1 domain protein  36.04 
 
 		 558 aa  298  2e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1474  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  33.27 
 
 		 561 aa  297  3e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.604813 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5555  2-octaprenylphenol hydroxylase  32.7 
 
 		 584 aa  296  6e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0017  2-octaprenylphenol hydroxylase  32.55 
 
 		 592 aa  295  2e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.300768 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2071  ABC-1 domain protein  33.51 
 
 		 581 aa  293  4e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0987216  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3247  ABC-1 domain protein  34.84 
 
 		 558 aa  293  6e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000474003  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2586  ABC-1 domain protein  35.94 
 
 		 562 aa  291  3e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12230  2-octaprenylphenol hydroxylase  32.26 
 
 		 559 aa  289  8e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0233  2-octaprenylphenol hydroxylase  34.85 
 
 		 554 aa  286  5.999999999999999e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1612  ABC-1 domain protein  33.39 
 
 		 557 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.504596  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0324  ABC-1 domain protein  32.81 
 
 		 581 aa  282  1e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2106  hypothetical protein  33.9 
 
 		 559 aa  281  2e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766182 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1733  hypothetical protein  33.2 
 
 		 557 aa  280  4e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00187554  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1337  2-octaprenylphenol hydroxylase  34.06 
 
 		 549 aa  280  4e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2852  ubiquinone biosynthesis protein  31.57 
 
 		 559 aa  280  5e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2150  ABC-1 domain protein  35.6 
 
 		 557 aa  279  9e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.181383  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0825  ABC-1 domain protein  29.82 
 
 		 558 aa  276  8e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1464  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  31.87 
 
 		 555 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00546242  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2240  ABC-1 domain protein  35.21 
 
 		 557 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.319336  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1172  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  31.96 
 
 		 558 aa  272  1e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1699  2-octaprenylphenol hydroxylase  36.34 
 
 		 557 aa  272  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2664  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.31 
 
 		 573 aa  271  2e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.948881  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0295  ABC-1 domain protein  30.53 
 
 		 558 aa  271  2e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1807  hypothetical protein  30.05 
 
 		 560 aa  270  4e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4898  ABC1 family protein  31.35 
 
 		 558 aa  268  2e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4176  hypothetical protein  32.46 
 
 		 582 aa  268  2e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.118279  normal  0.965064 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2519  hypothetical protein  31.82 
 
 		 582 aa  267  2.9999999999999995e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.416254 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1693  ABC-1 domain protein  31.35 
 
 		 565 aa  264  3e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12515  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5305  ABC-1 domain protein  31.35 
 
 		 565 aa  264  3e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1598  hypothetical protein  31.21 
 
 		 591 aa  262  1e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.429743  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1207  ABC transporter  31.33 
 
 		 556 aa  260  4e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.694462  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0390  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.46 
 
 		 559 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1228  unusual protein kinase  30.67 
 
 		 606 aa  253  9.000000000000001e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.99408  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0342  ABC1 family protein  31.78 
 
 		 551 aa  252  1e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2537  hypothetical protein  31.68 
 
 		 537 aa  250  5e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2852  hypothetical protein  31.14 
 
 		 537 aa  246  6.999999999999999e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4049  hypothetical protein  32.73 
 
 		 556 aa  246  9.999999999999999e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.240057  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3494  2-octaprenylphenol hydroxylase  30.63 
 
 		 530 aa  244  1.9999999999999999e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2205  hypothetical protein  30.53 
 
 		 552 aa  244  3e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3377  ABC-1 domain protein  33.4 
 
 		 557 aa  243  6e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118171 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0769  ABC-1 domain protein  30.98 
 
 		 543 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.477502 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1021  hypothetical protein  30.98 
 
 		 556 aa  239  9e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.396117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1817  hypothetical protein  31.62 
 
 		 571 aa  239  9e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.457399  normal  0.0626146 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1333  ABC-1 domain protein  30.61 
 
 		 543 aa  239  1e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1843  hypothetical protein  30.43 
 
 		 549 aa  239  1e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.295975  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0176  2-octaprenylphenol hydroxylase  29.81 
 
 		 547 aa  236  8e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0240  ABC-1 domain protein  31.77 
 
 		 544 aa  236  1.0000000000000001e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3956  ABC-1 domain protein  32.64 
 
 		 552 aa  235  1.0000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.186201 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2415  hypothetical protein  30.51 
 
 		 545 aa  234  3e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0766121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0243  hypothetical protein  30.28 
 
 		 565 aa  234  3e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.469557  normal  0.547936 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0578  hypothetical protein  33.73 
 
 		 560 aa  233  6e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3425  hypothetical protein  32.97 
 
 		 563 aa  233  8.000000000000001e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.416231  normal  0.872879 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0868  hypothetical protein  31.99 
 
 		 582 aa  232  1e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000924249  normal  0.0678292 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3020  hypothetical protein  31.67 
 
 		 544 aa  231  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5113  ABC-1 domain protein  32.67 
 
 		 544 aa  231  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4701  ABC-1 domain protein  31.42 
 
 		 576 aa  230  4e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2019  ubiquinone biosynthesis protein AarF  34.49 
 
 		 542 aa  228  2e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3964  ABC-1 domain-containing protein  30.57 
 
 		 561 aa  226  1e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0631  hypothetical protein  32.49 
 
 		 558 aa  224  3e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.206757 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0626  ABC-1 domain protein  33.19 
 
 		 585 aa  224  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1536  ABC-1 domain protein  30.66 
 
 		 556 aa  223  7e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0222  ABC-1 domain protein  29.74 
 
 		 571 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.164391  normal  0.703829 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1310  ABC-1 domain protein  29.88 
 
 		 562 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1338  ABC-1 domain protein  29.88 
 
 		 562 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000328718 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0159  ABC-1 domain protein  30.41 
 
 		 561 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0155  ABC-1 domain protein  30.41 
 
 		 584 aa  220  6e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00185412  normal  0.0113585 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3375  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  30.2 
 
 		 549 aa  220  6e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0784  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  30.57 
 
 		 517 aa  219  1e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10840  predicted unusual protein kinase  29.49 
 
 		 550 aa  218  2e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3381  hypothetical protein  31.22 
 
 		 578 aa  218  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4098  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  30.21 
 
 		 549 aa  217  4e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5804  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  30.89 
 
 		 533 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66920  ubiquinone biosynthesis protein UbiB  32.77 
 
 		 533 aa  216  9e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2430  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  28.7 
 
 		 544 aa  216  9.999999999999999e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0525  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  30.59 
 
 		 549 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1941  ABC-1 domain protein  31.04 
 
 		 549 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4126  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  31.01 
 
 		 521 aa  214  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0185917  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03488  predicted protein kinase  32.03 
 
 		 529 aa  214  2.9999999999999995e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0374  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  29.87 
 
 		 525 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.218508 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0387  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  34.23 
 
 		 539 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3415  hypothetical protein  30.37 
 
 		 560 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00362763 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0336  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  30.57 
 
 		 525 aa  213  9e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0351  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  30.57 
 
 		 525 aa  213  9e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.594267 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>