21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1636 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1636  hypothetical protein  100 
 
 		 221 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.696644  normal  0.905596 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2584  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  29.9 
 
 		 213 aa  97.4  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0089  exonuclease  30.72 
 
 		 233 aa  79.7  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.289343 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4098  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.8 
 
 		 233 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4703  exonuclease  28.81 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.205144  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0353  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.35 
 
 		 236 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.970254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0902  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.53 
 
 		 235 aa  69.7  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4849  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.77 
 
 		 236 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0470  exonuclease, putative  27.87 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0379  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.35 
 
 		 236 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.747837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0381  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.18 
 
 		 236 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.738013  normal  0.331802 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5186  exonuclease  26.07 
 
 		 235 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.229542  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05890  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.66 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1024  exonuclease  24.43 
 
 		 236 aa  53.5  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.747104  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1305  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.43 
 
 		 232 aa  48.9  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.770765 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3347  exonuclease  25.81 
 
 		 233 aa  47.8  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1721  DNA polymerase III PolC  24.58 
 
 		 1390 aa  45.1  0.0008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.670328  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0145  DNA polymerase III, epsilon subunit  24.55 
 
 		 235 aa  43.5  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1752  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  29.1 
 
 		 228 aa  43.1  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.974863  normal  0.0312157 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2479  DNA polymerase III, epsilon subunit  24.31 
 
 		 209 aa  42.4  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.114272  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1452  DNA polymerase III subunit epsilon  21.99 
 
 		 205 aa  41.6  0.01  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>