More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0669 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_0669  hypothetical protein  100 
 
 
243 aa  495  1e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0954341  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1607  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  61.51 
 
 
241 aa  305  3e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.096074  normal  0.366344 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1206  hypothetical protein  61.51 
 
 
241 aa  305  5.0000000000000004e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.546437  normal  0.272976 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1611  hypothetical protein  61.51 
 
 
241 aa  304  9.000000000000001e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0746419  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1935  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  60.67 
 
 
241 aa  302  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.907916  normal  0.0152527 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1310  hypothetical protein  60.25 
 
 
241 aa  297  1e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2222  hypothetical protein  60.25 
 
 
263 aa  296  1e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1713  hypothetical protein  60.25 
 
 
240 aa  296  2e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.8421  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2660  hypothetical protein  60.25 
 
 
240 aa  296  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2738  Fe-S oxidoreductase  60.25 
 
 
240 aa  296  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2604  hypothetical protein  60.25 
 
 
240 aa  296  2e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.186656  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3098  hypothetical protein  60.25 
 
 
240 aa  296  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00812964  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1494  hypothetical protein  60.25 
 
 
240 aa  296  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1870  hypothetical protein  60.67 
 
 
240 aa  295  3e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214075  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1547  hypothetical protein  59 
 
 
240 aa  295  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.198081  normal  0.0351499 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1464  hypothetical protein  59.83 
 
 
240 aa  294  8e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.270606  normal  0.902058 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2585  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  59.83 
 
 
240 aa  294  9e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.749181  hitchhiker  0.00208948 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5437  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  59.83 
 
 
240 aa  292  3e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.135566  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2148  hypothetical protein  59.41 
 
 
240 aa  292  3e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.11459  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2041  hypothetical protein  59.83 
 
 
240 aa  291  6e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.914482  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2168  hypothetical protein  59.83 
 
 
240 aa  291  8e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5946  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  59 
 
 
240 aa  288  4e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0860628  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2131  hypothetical protein  59 
 
 
240 aa  288  4e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198327  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1139  hypothetical protein  59.57 
 
 
236 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.79138  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0367  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  55.88 
 
 
259 aa  281  8.000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3164  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  55.88 
 
 
256 aa  272  4.0000000000000004e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1769  hypothetical protein  54.55 
 
 
266 aa  269  2e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.329693  normal  0.0772008 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1431  hypothetical protein  55.83 
 
 
268 aa  262  3e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.667811  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0867  hypothetical protein  55.83 
 
 
268 aa  262  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.258503  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2182  hypothetical protein  55.83 
 
 
268 aa  262  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0458  hypothetical protein  55.83 
 
 
268 aa  262  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1873  hypothetical protein  55.83 
 
 
289 aa  262  4e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0555  Fe-S oxidoreductase  55.42 
 
 
268 aa  260  1e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3606  hypothetical protein  54.2 
 
 
270 aa  259  3e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2080  hypothetical protein  55.42 
 
 
268 aa  259  3e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.945675  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1690  glycolate oxidase-like protein  48.32 
 
 
274 aa  249  2e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2926  hypothetical protein  53.16 
 
 
256 aa  248  7e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0345775  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0140  hypothetical protein  53.78 
 
 
263 aa  247  1e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3589  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  53.33 
 
 
265 aa  240  2e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2282  hypothetical protein  56.49 
 
 
260 aa  239  2.9999999999999997e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.293484  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0392  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  47.68 
 
 
238 aa  231  6e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1024  hypothetical protein  47.26 
 
 
239 aa  231  8.000000000000001e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2958  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, iron-sulfur subunit  44.63 
 
 
242 aa  230  2e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0079  hypothetical protein  49.17 
 
 
260 aa  229  2e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.376514  unclonable  0.0000154463 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3263  hypothetical protein  44.21 
 
 
242 aa  229  4e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3037  hypothetical protein  43.8 
 
 
242 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.291586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3270  hypothetical protein  43.8 
 
 
242 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3990  hypothetical protein  45.99 
 
 
239 aa  226  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.441671  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0560  hypothetical protein  51.87 
 
 
265 aa  226  2e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.221453  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1218  hypothetical protein  46.41 
 
 
239 aa  226  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1354  hypothetical protein  45.99 
 
 
239 aa  226  4e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1216  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  49.16 
 
 
244 aa  224  1e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.770234  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1416  hypothetical protein  45.99 
 
 
239 aa  223  2e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1456  hypothetical protein  45.99 
 
 
239 aa  223  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1216  hypothetical protein  45.99 
 
 
239 aa  223  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0407054  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1194  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, iron-sulfur subunit  45.99 
 
 
239 aa  223  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1196  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, iron-sulfur subunit  45.99 
 
 
239 aa  223  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0498426  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1315  hypothetical protein  45.99 
 
 
239 aa  223  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2429  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  50.83 
 
 
248 aa  223  2e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267816 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1392  hypothetical protein  45.57 
 
 
239 aa  221  6e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1274  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  47.26 
 
 
239 aa  218  6e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0717  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  45.8 
 
 
248 aa  218  7.999999999999999e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5452  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  44.17 
 
 
239 aa  211  7e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.625319 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1905  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40 
 
 
245 aa  202  4e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2722  hypothetical protein  43.7 
 
 
242 aa  200  9.999999999999999e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.451695  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3243  hypothetical protein  46.44 
 
 
234 aa  196  3e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.496148  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2718  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  45.57 
 
 
247 aa  195  5.000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4458  hypothetical protein  44.73 
 
 
247 aa  194  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.169961 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2593  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  44.96 
 
 
270 aa  192  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.128565  normal  0.0827191 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0810  hypothetical protein  45.15 
 
 
249 aa  193  3e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0233285 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1749  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  42.02 
 
 
239 aa  187  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0856492  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0967  hypothetical protein  40.51 
 
 
245 aa  187  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3038  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  43.98 
 
 
246 aa  186  4e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3259  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.25 
 
 
240 aa  185  5e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0709  hypothetical protein  39.58 
 
 
243 aa  185  5e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.162619  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05530  Fe-S oxidoreductase  41.87 
 
 
248 aa  185  6e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1896  Fe-S oxidoreductase  41.18 
 
 
256 aa  184  7e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.138109  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37080  Fe-S oxidoreductase  43.04 
 
 
243 aa  184  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.151092  normal  0.0205493 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2995  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  43.1 
 
 
246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1437  oxidoreductase  41.6 
 
 
246 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.147364  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12950  Fe-S oxidoreductase  43.5 
 
 
261 aa  181  1e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0443672  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0818  hypothetical protein  41.07 
 
 
241 aa  179  4e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.212327  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0338  hypothetical protein  40.76 
 
 
239 aa  177  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0695  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  43.6 
 
 
244 aa  177  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.282558  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2677  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  39.92 
 
 
239 aa  177  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0359  cysteine-rich domain protein  40.76 
 
 
239 aa  176  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.477523 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0259  cysteine-rich domain protein  40.76 
 
 
239 aa  176  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00262  predicted oxidoreductase  40.76 
 
 
239 aa  176  3e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3299  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40.76 
 
 
239 aa  176  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0321  hypothetical protein  40.76 
 
 
239 aa  176  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00266  hypothetical protein  40.76 
 
 
239 aa  176  3e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0359  hypothetical protein  40.76 
 
 
239 aa  176  3e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.368337  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4922  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  38.87 
 
 
246 aa  175  6e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00884029  normal  0.244151 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1234  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  42.44 
 
 
239 aa  174  9e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.399981  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3104  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.87 
 
 
267 aa  172  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3316  hypothetical protein  40.34 
 
 
239 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5448  hypothetical protein  40.42 
 
 
259 aa  172  5e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.950541  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2452  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  41.25 
 
 
247 aa  172  5e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.345477  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6081  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  43.46 
 
 
266 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.364654 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3730  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40.89 
 
 
249 aa  171  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0542099  normal  0.363647 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>