19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3961 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3961  prevent-host-death family protein  100 
 
 		 86 aa  174  4e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.986483  normal  0.184191 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2874  prevent-host-death family protein  61.9 
 
 		 85 aa  108  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2535  prevent-host-death protein  58.54 
 
 		 85 aa  100  8e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.784194  normal  0.833179 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1822  prevent-host-death family protein  41.67 
 
 		 81 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.307814  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3421  prevent-host-death family protein  44.07 
 
 		 83 aa  50.8  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.985918 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2340  prevent-host-death family protein  36.67 
 
 		 82 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0012  prevent-host-death protein  42 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.93374 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0714  prevent-host-death family protein  36.96 
 
 		 93 aa  44.7  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000667491  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1697  prevent-host-death family protein  32.61 
 
 		 82 aa  43.9  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000276102  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5092  prevent-host-death family protein  37.5 
 
 		 112 aa  42.7  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1595  prevent-host-death family protein  32.61 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3828  addiction module antitoxin  34 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.899294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3930  Axe family addiction module antitoxin  34 
 
 		 73 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4514  prevent-host-death protein  40 
 
 		 91 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.680635  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4542  prevent-host-death family protein  40.43 
 
 		 85 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1603  prevent-host-death protein  36.51 
 
 		 85 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.916276  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6276  prevent-host-death family protein  35.09 
 
 		 84 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2538  prevent-host-death family protein  33.33 
 
 		 84 aa  40.4  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.91328 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0506  hypothetical protein  34.57 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.275503 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>