66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3777 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3777  lactoylglutathione lyase  100 
 
 		 156 aa  318  1.9999999999999998e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.34023  normal  0.73054 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2044  lactoylglutathione lyase  93.38 
 
 		 153 aa  289  1e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0204479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1854  lactoylglutathione lyase  92.72 
 
 		 153 aa  287  4e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2516  lactoylglutathione lyase  84.42 
 
 		 155 aa  273  6e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.345514  normal  0.625543 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3408  lactoylglutathione lyase  86.09 
 
 		 155 aa  271  2.0000000000000002e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.17438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2801  lactoylglutathione lyase  79.22 
 
 		 169 aa  268  2e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.233135  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2133  lactoylglutathione lyase  79.33 
 
 		 163 aa  259  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2168  lactoylglutathione lyase  78.67 
 
 		 156 aa  256  9e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.71915  normal  0.221606 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2692  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  76.16 
 
 		 153 aa  254  4e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.208446 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2378  lactoylglutathione lyase  76.82 
 
 		 162 aa  253  5e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.19927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1018  methylmalonyl-CoA epimerase  75.66 
 
 		 154 aa  253  5e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.898469 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1139  lactoylglutathione lyase  76.16 
 
 		 158 aa  248  3e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0160396  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0914  lactoylglutathione lyase  73.33 
 
 		 155 aa  244  3e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0928  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  74 
 
 		 155 aa  243  6e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0300  lactoylglutathione lyase  75.33 
 
 		 158 aa  242  9.999999999999999e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00424343  normal  0.149575 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5323  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  67.11 
 
 		 158 aa  227  5e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46728  predicted protein  56.49 
 
 		 186 aa  192  1e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.115026  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0916  methylmalonyl-CoA epimerase  30.56 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.311023 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1852  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.57 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0455  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.87 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.571993 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0080  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.57 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3303  methylmalonyl-CoA epimerase  28.06 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000981467  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6000  methylmalonyl-CoA epimerase  28.29 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0251153 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0558  methylmalonyl-CoA epimerase  26.57 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000977172  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0571  methylmalonyl-CoA epimerase  25.87 
 
 		 137 aa  50.8  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.82853e-18 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0230  methylmalonyl-CoA epimerase  40.62 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0953  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.37 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0254493 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2364  methylmalonyl-CoA epimerase  34.09 
 
 		 135 aa  47.8  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1361  methylmalonyl-CoA epimerase  28.87 
 
 		 129 aa  47.4  0.00007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.7651e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1167  methylmalonyl-CoA epimerase  27.46 
 
 		 135 aa  47.4  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.217696  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0655  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.12 
 
 		 134 aa  47.4  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195436  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0522  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.74 
 
 		 134 aa  47  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014865  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4074  methylmalonyl-CoA epimerase  29.71 
 
 		 133 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0584893  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0306  methylmalonyl-CoA epimerase  26.23 
 
 		 141 aa  47  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3253  methylmalonyl-CoA epimerase  27.05 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000018375  hitchhiker  3.27573e-17 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4223  methylmalonyl-CoA epimerase  28.99 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1488  methylmalonyl-CoA epimerase  25.37 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.383789  normal  0.131397 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3258  methylmalonyl-CoA epimerase  26.83 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000316472  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4198  methylmalonyl-CoA epimerase  28.99 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0349  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.66 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0717499  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3148  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.41 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3939  methylmalonyl-CoA epimerase  28.77 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.368557  normal  0.0232297 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3865  methylmalonyl-CoA epimerase  28.77 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.241683  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2285  methylmalonyl-CoA epimerase  24.11 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000102737  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1282  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.41 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3851  methylmalonyl-CoA epimerase  28.08 
 
 		 156 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00602371 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2006  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.23 
 
 		 140 aa  44.7  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0290  methylmalonyl-CoA epimerase  24.39 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3770  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.29 
 
 		 133 aa  44.3  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0196484  normal  0.0212812 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3321  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.58 
 
 		 128 aa  44.3  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1623  methylmalonyl-CoA epimerase  33.33 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11354  hypothetical protein  28.77 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.498935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0384  methylmalonyl-CoA epimerase  28.37 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1696  methylmalonyl-CoA epimerase  27.14 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.019096  normal  0.134039 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3022  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.91 
 
 		 162 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.57641 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2339  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.4 
 
 		 168 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.630848  normal  0.527959 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3611  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.46 
 
 		 157 aa  41.6  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03285  Lactoylglutathione lyase and related lyase  22.39 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.275732  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5865  methylmalonyl-CoA epimerase  25.35 
 
 		 136 aa  41.6  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28560  methylmalonyl-CoA epimerase  26.67 
 
 		 153 aa  41.2  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.215327 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4306  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.45 
 
 		 161 aa  41.2  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725625 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3197  methylmalonyl-CoA epimerase  24.46 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2781  methylmalonyl-CoA epimerase  28.91 
 
 		 141 aa  40.8  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0725  hypothetical protein  29.41 
 
 		 129 aa  40.8  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.542377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0198  hypothetical protein  28.43 
 
 		 129 aa  40.4  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4142  methylmalonyl-CoA epimerase  26.95 
 
 		 134 aa  40.4  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.65243  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>