26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1527 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1527  periplasmic lipoprotein-like protein  100 
 
 		 361 aa  725    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0309667 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2563  periplasmic lipoprotein-like protein  47.66 
 
 		 369 aa  297  2e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.440484  hitchhiker  0.00108015 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1923  periplasmic lipoprotein-like protein  51.34 
 
 		 375 aa  289  4e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.576984  hitchhiker  0.00344401 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1460  periplasmic lipolike protein  47.93 
 
 		 371 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0139053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56850  putative lipoprotein  24.04 
 
 		 354 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3297  periplasmic lipoprotein-like protein  27.95 
 
 		 353 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4477  lipoprotein  24.36 
 
 		 354 aa  57  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.24024  normal  0.364663 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0333  hypothetical protein  25 
 
 		 374 aa  56.6  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0977  lipoprotein  24.84 
 
 		 354 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00313194 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4941  putative lipoprotein  24.55 
 
 		 354 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2143  periplasmic lipoprotein-like protein  22.88 
 
 		 380 aa  54.7  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0403933 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3870  Peptidase M75, Imelysin  25.81 
 
 		 391 aa  54.7  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.755425  normal  0.516703 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0948  periplasmic lipoprotein-like protein  25.32 
 
 		 354 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0909  hypothetical protein  25.32 
 
 		 354 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02712  hypothetical protein  24.19 
 
 		 345 aa  52.8  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1802  hypothetical protein  22.95 
 
 		 389 aa  51.6  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4490  putative lipoprotein  24.03 
 
 		 354 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.020416 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2084  hypothetical protein  22.4 
 
 		 387 aa  49.7  0.00008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.868997 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37860  hypothetical protein  25.65 
 
 		 354 aa  48.9  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.214112  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003125  iron-regulated protein A precursor  23.53 
 
 		 345 aa  47.4  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.392653  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4368  lipoprotein, putative  23.87 
 
 		 354 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4313  hypothetical protein  25.21 
 
 		 366 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4064  putative lipoprotein  23.23 
 
 		 354 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.82498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2559  periplasmic lipoprotein-like protein  23.16 
 
 		 352 aa  45.1  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0351138  hitchhiker  0.00000000167803 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3527  putative signal peptide protein  27.5 
 
 		 377 aa  43.9  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793517  normal  0.789193 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4576  hypothetical protein  24.06 
 
 		 366 aa  43.1  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0477994 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>