52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0899 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0899  methyltransferase type 12  100 
 
 		 215 aa  436  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.784236 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2324  methyltransferase type 11  74.53 
 
 		 222 aa  322  2e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1535  Methyltransferase type 11  75.37 
 
 		 201 aa  313  9.999999999999999e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4620  methyltransferase type 12  71.92 
 
 		 201 aa  302  2.0000000000000002e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280796 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0486  Methyltransferase type 12  44.33 
 
 		 223 aa  152  4e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.456379  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0481  Methyltransferase type 12  43.81 
 
 		 223 aa  151  7e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.643752  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0453  methyltransferase type 12  43.81 
 
 		 224 aa  150  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1470  methyltransferase type 12  38.46 
 
 		 201 aa  127  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.681484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1247  Methyltransferase type 12  34.39 
 
 		 196 aa  88.2  9e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172462 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0150  methyltransferase type 12  30.41 
 
 		 199 aa  82.4  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01812  hypothetical protein  31.82 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0429633  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0171  hypothetical protein  31.28 
 
 		 199 aa  74.7  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.713458  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50330  hypothetical protein  37.23 
 
 		 253 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.271099  hitchhiker  0.000351246 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2839  methyltransferase type 12  32.69 
 
 		 256 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.323425  normal  0.120008 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2002  Trans-aconitate 2-methyltransferase  33.68 
 
 		 258 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.681077 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2989  Methyltransferase type 11  35.9 
 
 		 270 aa  49.7  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000120063  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2107  methyltransferase type 11  31.41 
 
 		 273 aa  49.3  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1459  Methyltransferase type 11  32.19 
 
 		 250 aa  48.9  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3413  Methyltransferase type 12  32.06 
 
 		 255 aa  48.9  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0096  methyltransferase type 12  32.81 
 
 		 225 aa  48.5  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.19 
 
 		 243 aa  48.5  0.00008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.19 
 
 		 234 aa  48.1  0.00009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1769  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 273 aa  48.1  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1849  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 273 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 194 aa  47.4  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0946  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.45 
 
 		 232 aa  46.6  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6814  Methyltransferase type 11  31.13 
 
 		 219 aa  46.2  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1234  Methyltransferase type 12  32.2 
 
 		 269 aa  45.1  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.186171 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  40.4 
 
 		 215 aa  45.1  0.0008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2805  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.96 
 
 		 261 aa  45.1  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3508  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.61 
 
 		 257 aa  44.7  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.510981  normal  0.74985 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2231  methyltransferase type 11  30.1 
 
 		 214 aa  44.7  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1063  hypothetical protein  28.48 
 
 		 276 aa  44.7  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.051758  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3459  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.63 
 
 		 256 aa  44.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.064868  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1327  trans-aconitate methyltransferase, putative  32.63 
 
 		 256 aa  44.3  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0190  methyltransferase type 11  23.95 
 
 		 184 aa  43.9  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.561898 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.65 
 
 		 257 aa  43.1  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6101  methyltransferase type 11  34.29 
 
 		 320 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1028  hypothetical protein  27.88 
 
 		 255 aa  43.5  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1590  methyltransferase  28.97 
 
 		 219 aa  42.7  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6510  methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 320 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1319  methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 320 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284137  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3809  SAM binding protein  31.43 
 
 		 219 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.914048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.89 
 
 		 238 aa  42.4  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4185  biotin synthesis protein BioC, putative  29.9 
 
 		 269 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1576  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.58 
 
 		 229 aa  42  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0819441  unclonable  0.000000165496 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3392  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.87 
 
 		 221 aa  41.6  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1317  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  28.7 
 
 		 229 aa  42  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124117  hitchhiker  3.42912e-24 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2203  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.47 
 
 		 258 aa  41.6  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.968625  hitchhiker  0.00608144 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4124  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.17 
 
 		 261 aa  41.6  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.104917 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2668  hypothetical protein  25.2 
 
 		 275 aa  41.6  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.7 
 
 		 246 aa  41.6  0.01  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>