14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_5111 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_5111  hypothetical protein  100 
 
 
251 aa  509  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.370649 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0912  hypothetical protein  57.86 
 
 
251 aa  180  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251322  hitchhiker  0.0061785 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4184  sensor protein  27.54 
 
 
1048 aa  56.2  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00072831 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  30.23 
 
 
1348 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  28.57 
 
 
1363 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  33.33 
 
 
1656 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  44.64 
 
 
406 aa  49.3  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  44.64 
 
 
406 aa  49.3  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4289  hypothetical protein  27.47 
 
 
137 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2655  hypothetical protein  32.56 
 
 
278 aa  47  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0589168  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0047  hypothetical protein  31.18 
 
 
234 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000487124  normal  0.972099 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0746  TIR protein  28.57 
 
 
598 aa  43.9  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4630  TIR protein  30.38 
 
 
291 aa  43.1  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.788158  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0066  hypothetical protein  28.57 
 
 
384 aa  42.7  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>