19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0173 on replicon NC_011885
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011885  Cyan7425_0173  hypothetical protein  100 
 
 
83 aa  162  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.315978 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5307  hypothetical protein  85.54 
 
 
83 aa  137  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.276905  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1083  hypothetical protein  40.96 
 
 
84 aa  66.2  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0409  hypothetical protein  48.19 
 
 
83 aa  65.1  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.74354  normal  0.255038 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1082  hypothetical protein  43.75 
 
 
88 aa  62.4  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.109568  normal  0.721009 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0161  protein of unknown function UPF0175  40.74 
 
 
86 aa  55.1  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0647  hypothetical protein  40.74 
 
 
86 aa  54.3  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5352  protein of unknown function UPF0175  31.33 
 
 
84 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.104771 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4274  hypothetical protein  28.75 
 
 
83 aa  48.5  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.237856 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0052  protein of unknown function UPF0175  40 
 
 
82 aa  48.1  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0476842  normal  0.242874 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4031  hypothetical protein  35.44 
 
 
82 aa  47.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.297352 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2349  hypothetical protein  37.7 
 
 
86 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.240227  normal  0.168126 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1353  protein of unknown function UPF0175  33.73 
 
 
94 aa  46.2  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00774094  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1012  protein of unknown function UPF0175  37.68 
 
 
75 aa  45.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2063  protein of unknown function UPF0175  32.91 
 
 
82 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1451  protein of unknown function UPF0175  39.47 
 
 
84 aa  42.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2482  hypothetical protein  32.5 
 
 
82 aa  40.8  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0101  protein of unknown function UPF0175  36.36 
 
 
87 aa  40.4  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1485  hypothetical protein  38.6 
 
 
85 aa  40.4  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.152276  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>