53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0405 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0405  hypothetical protein  100 
 
 
394 aa  760    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.272447 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3454  hypothetical protein  57.29 
 
 
396 aa  377  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.863709  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2986  hypothetical protein  56.02 
 
 
355 aa  363  4e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.223704  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3030  hypothetical protein  56.02 
 
 
355 aa  363  4e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0821  hypothetical protein  53.99 
 
 
391 aa  358  9e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.452627  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3001  hypothetical protein  54.9 
 
 
355 aa  356  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0393285  normal  0.0371418 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3338  hypothetical protein  54.62 
 
 
395 aa  348  1e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3547  hypothetical protein  52.76 
 
 
412 aa  345  6e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.412698 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1617  hypothetical protein  52.58 
 
 
391 aa  331  2e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.862313  normal  0.915931 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4213  hypothetical protein  50.55 
 
 
397 aa  317  3e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7108  hypothetical protein  44.94 
 
 
387 aa  295  8e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.273158  normal  0.753701 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4941  hypothetical protein  44.04 
 
 
392 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0441  hypothetical protein  30 
 
 
373 aa  88.6  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.22704 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1894  hypothetical protein  28.45 
 
 
367 aa  79.3  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143005  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0139  hypothetical protein  30.22 
 
 
393 aa  78.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3022  hypothetical protein  29.25 
 
 
395 aa  70.5  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.628375  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3435  protein of unknown function DUF1006  28.01 
 
 
382 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0019  hypothetical protein  28.37 
 
 
389 aa  68.6  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2728  hypothetical protein  26.02 
 
 
367 aa  68.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.683635  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3488  hypothetical protein  27.97 
 
 
355 aa  67  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4094  hypothetical protein  26.04 
 
 
389 aa  66.2  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7635  hypothetical protein  29.12 
 
 
363 aa  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.678328 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3538  hypothetical protein  27.52 
 
 
398 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0164  hypothetical protein  29.02 
 
 
355 aa  63.9  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5461  hypothetical protein  28.61 
 
 
367 aa  62.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.898004  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6013  hypothetical protein  26.73 
 
 
342 aa  62.4  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.994195  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1484  hypothetical protein  27.69 
 
 
378 aa  61.6  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0801709  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3996  hypothetical protein  29.07 
 
 
397 aa  60.5  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.880784  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7095  hypothetical protein  29.21 
 
 
362 aa  60.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4303  hypothetical protein  30.33 
 
 
374 aa  59.7  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2734  hypothetical protein  31.14 
 
 
378 aa  59.7  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00345786 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0878  hypothetical protein  18.56 
 
 
357 aa  58.2  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5246  hypothetical protein  30.79 
 
 
366 aa  57  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.422141 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4984  hypothetical protein  28.24 
 
 
373 aa  55.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.405454  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1330  hypothetical protein  35.16 
 
 
353 aa  55.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789559  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2094  hypothetical protein  31.67 
 
 
370 aa  55.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0155004  normal  0.0950605 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3510  hypothetical protein  29.78 
 
 
404 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0541422  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2452  hypothetical protein  25.69 
 
 
384 aa  53.5  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000678716  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0629  hypothetical protein  26.46 
 
 
367 aa  52.8  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4281  hypothetical protein  30.2 
 
 
374 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.355185  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0975  hypothetical protein  29.3 
 
 
377 aa  51.2  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2792  hypothetical protein  26.57 
 
 
362 aa  51.2  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0226993  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2067  hypothetical protein  26.17 
 
 
379 aa  50.8  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0357547 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4070  hypothetical protein  25.63 
 
 
365 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0178352  normal  0.419833 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3211  hypothetical protein  29.8 
 
 
368 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474284  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3370  hypothetical protein  25.97 
 
 
368 aa  48.9  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.357323 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4150  hypothetical protein  31.98 
 
 
374 aa  46.6  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4042  hypothetical protein  30.86 
 
 
363 aa  46.6  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00590442 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0286  hypothetical protein  28.17 
 
 
375 aa  45.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.513722 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1410  hypothetical protein  33.06 
 
 
352 aa  44.7  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.246412  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6205  hypothetical protein  29.15 
 
 
372 aa  44.3  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.454836  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1792  hypothetical protein  23.21 
 
 
377 aa  44.3  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5228  hypothetical protein  24.71 
 
 
383 aa  42.7  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160159  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>