41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_3191 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_3191  chromosome partitioning ATPase  100 
 
 		 406 aa  825    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.984845  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1340  hypothetical protein  31.34 
 
 		 375 aa  209  6e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0502  hypothetical protein  26.03 
 
 		 378 aa  114  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0002375  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16660  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.35 
 
 		 288 aa  62.4  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0179  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.66 
 
 		 287 aa  52.8  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000347298  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1853  AAA ATPase  25.47 
 
 		 397 aa  52.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0455079  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2685  flagellar synthesis regulator FleN  20.83 
 
 		 295 aa  51.2  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0515842  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1086  pilus assembly protein  24.54 
 
 		 439 aa  50.8  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.807258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4154  response regulator receiver protein  25.37 
 
 		 419 aa  50.4  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.268722 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0716  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.97 
 
 		 276 aa  50.1  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.47964  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0746  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.71 
 
 		 297 aa  50.1  0.00008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0959  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  27.55 
 
 		 372 aa  48.9  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.152007 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4612  response regulator receiver protein  23.41 
 
 		 417 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.936503  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1746  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  22.47 
 
 		 290 aa  47.8  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0779  chromosome partitioning ATPase  24.11 
 
 		 431 aa  47.4  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000669652  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2701  response regulator receiver protein  23.28 
 
 		 373 aa  47.4  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2355  response regulator receiver domain-containing protein  26.47 
 
 		 412 aa  47.4  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3353  response regulator receiver protein  25.96 
 
 		 419 aa  47  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2272  putative septum site-determining protein  23.39 
 
 		 537 aa  45.8  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1342  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.82 
 
 		 303 aa  46.2  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.292285  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  27.57 
 
 		 464 aa  46.2  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1726  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  25.47 
 
 		 414 aa  46.2  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0275  ATP-binding protein  21.6 
 
 		 295 aa  45.1  0.002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30460  flagellar number regulator; FleN  26.71 
 
 		 280 aa  45.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2334  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  22.61 
 
 		 249 aa  45.1  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1356  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.38 
 
 		 296 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0188424  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2638  putative flp pilus assembly protein CpaE  24.06 
 
 		 401 aa  44.7  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0590  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.16 
 
 		 301 aa  44.3  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1337  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.57 
 
 		 299 aa  44.3  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.299825  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07525  nucleotide binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G09810)  39.71 
 
 		 331 aa  43.9  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.463986 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3655  pilus assembly protein  24.71 
 
 		 412 aa  43.9  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2501  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.7 
 
 		 296 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308577  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2151  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  21.25 
 
 		 298 aa  43.9  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2597  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.7 
 
 		 296 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000736548  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4359  pilus assembly protein  24.29 
 
 		 447 aa  43.9  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4249  putative pilus assembly protein  24.29 
 
 		 447 aa  43.9  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.359357 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2362  response regulator receiver domain-containing protein  19.21 
 
 		 413 aa  43.5  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382482  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4669  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.7 
 
 		 280 aa  43.5  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197131  normal  0.373093 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2826  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  23.03 
 
 		 377 aa  43.1  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2554  response regulator receiver domain-containing protein  27.15 
 
 		 387 aa  43.1  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494037  normal  0.119042 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1174  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.28 
 
 		 274 aa  43.1  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.358901  normal  0.212206 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>