48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1514 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1514  hypothetical protein  100 
 
 		 292 aa  581  1.0000000000000001e-165  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000671391  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01890  uncharacterized membrane protein  60.21 
 
 		 297 aa  319  3e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0860  hypothetical protein  58.22 
 
 		 293 aa  306  3e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.110107  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1272  hypothetical protein  48.8 
 
 		 291 aa  296  3e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.679306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1653  hypothetical protein  50.87 
 
 		 291 aa  296  3e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.850435  normal  0.0303841 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1572  protein of unknown function DUF125 transmembrane  50.73 
 
 		 291 aa  296  4e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.493606  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1189  hypothetical protein  50.72 
 
 		 291 aa  294  9e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0423  hypothetical protein  53.6 
 
 		 284 aa  293  2e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1173  protein of unknown function DUF125 transmembrane  50.68 
 
 		 293 aa  293  2e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0438  hypothetical protein  53.6 
 
 		 284 aa  293  2e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0801  protein of unknown function DUF125 transmembrane  50 
 
 		 291 aa  293  2e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0215  protein of unknown function DUF125 transmembrane  50.52 
 
 		 300 aa  291  7e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1685  protein of unknown function DUF125 transmembrane  52.43 
 
 		 289 aa  285  5e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1070  hypothetical protein  50.74 
 
 		 292 aa  284  1.0000000000000001e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0912  protein of unknown function DUF125 transmembrane  48.91 
 
 		 291 aa  283  2.0000000000000002e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1196  protein of unknown function DUF125 transmembrane  49.45 
 
 		 285 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.679365 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1809  hypothetical protein  48.61 
 
 		 288 aa  278  9e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.305818  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1049  hypothetical protein  48.04 
 
 		 293 aa  248  8e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2800  protein of unknown function DUF125 transmembrane  46.74 
 
 		 292 aa  233  3e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.792813  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0331  hypothetical protein  41.49 
 
 		 287 aa  224  1e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.464299  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1758  hypothetical protein  31.54 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0216697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0704  hypothetical protein  32.2 
 
 		 299 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.258152  normal  0.502019 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0774  hypothetical protein  31.21 
 
 		 297 aa  154  1e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.443952 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0496  hypothetical protein  31.66 
 
 		 299 aa  139  6e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1650  hypothetical protein  31.07 
 
 		 290 aa  105  8e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.381623  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1094  hypothetical protein  33.51 
 
 		 374 aa  96.3  5e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0378  protein of unknown function DUF125 transmembrane  29.29 
 
 		 352 aa  81.3  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0516728  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1468  protein of unknown function DUF125 transmembrane  23.05 
 
 		 361 aa  78.2  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181021  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0835  protein of unknown function DUF125 transmembrane  24.11 
 
 		 358 aa  75.9  0.0000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0522  hypothetical protein  23.22 
 
 		 319 aa  71.6  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.655797  normal  0.060241 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0379  hypothetical protein  25 
 
 		 362 aa  59.3  0.00000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04290  uncharacterized membrane protein  25.13 
 
 		 376 aa  59.3  0.00000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4424  hypothetical protein  27.03 
 
 		 368 aa  57.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19590  uncharacterized membrane protein  34.29 
 
 		 232 aa  51.6  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.927854  normal  0.04221 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2329  protein of unknown function DUF125 transmembrane  33.78 
 
 		 241 aa  50.1  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.497478  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0844  hypothetical protein  23.2 
 
 		 387 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0962  protein of unknown function DUF125 transmembrane  23 
 
 		 396 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01320  uncharacterized membrane protein  24 
 
 		 365 aa  48.1  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0254  protein of unknown function DUF125 transmembrane  21.72 
 
 		 360 aa  46.6  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1509  hypothetical protein  30.88 
 
 		 227 aa  46.2  0.0007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0134552  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5110  protein of unknown function DUF125 transmembrane  34.78 
 
 		 238 aa  45.8  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2210  protein of unknown function DUF125 transmembrane  33.33 
 
 		 246 aa  44.3  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.303449  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1508  hypothetical protein  32.1 
 
 		 230 aa  45.1  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00139077  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0592  hypothetical protein  33.33 
 
 		 227 aa  45.1  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000251129  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0798  hypothetical protein  31.88 
 
 		 226 aa  43.5  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00535616  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0698  hypothetical protein  33.33 
 
 		 233 aa  43.5  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0161  protein of unknown function DUF125 transmembrane  23.79 
 
 		 399 aa  43.1  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.279325  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3399  protein of unknown function DUF125 transmembrane  28.38 
 
 		 234 aa  42.4  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.233589 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>