More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1488 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1488  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 758 aa  1517    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3226  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.12 
 
 		 732 aa  335  1e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000536436  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0201  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.06 
 
 		 736 aa  224  3e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00388216  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2304  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.98 
 
 		 713 aa  220  7.999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.28 
 
 		 564 aa  185  3e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000139892  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2152  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.41 
 
 		 655 aa  184  4.0000000000000006e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.697016  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4649  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.49 
 
 		 653 aa  182  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1373  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.49 
 
 		 571 aa  175  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2011  methyl-accepting chemotaxis protein  27.02 
 
 		 660 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0544  methyl-accepting chemotaxis protein  30.33 
 
 		 660 aa  174  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0138447  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0575  methyl-accepting chemotaxis protein  30.33 
 
 		 660 aa  174  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3298  methyl-accepting chemotaxis protein  26.52 
 
 		 660 aa  174  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.220146 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2151  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.85 
 
 		 656 aa  173  9e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0486  methyl-accepting chemotaxis protein  30.33 
 
 		 660 aa  173  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0918  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  27.57 
 
 		 657 aa  173  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2356  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.55 
 
 		 415 aa  172  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.120093  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2101  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.87 
 
 		 565 aa  172  3e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0488  methyl-accepting chemotaxis protein  30.33 
 
 		 660 aa  171  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1516  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.28 
 
 		 660 aa  172  3e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0613  methyl-accepting chemotaxis protein  30.93 
 
 		 660 aa  171  5e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4726  methyl-accepting chemotaxis protein  30.25 
 
 		 660 aa  170  7e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.520736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  30.72 
 
 		 650 aa  171  7e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1675  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.65 
 
 		 572 aa  170  8e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1867  methyl-accepting chemotaxis protein  26.63 
 
 		 660 aa  170  8e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0469  methyl-accepting chemotaxis protein  31.07 
 
 		 658 aa  170  8e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1821  methyl-accepting chemotaxis protein  26.63 
 
 		 660 aa  170  8e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2009  methyl-accepting chemotaxis protein  26.63 
 
 		 660 aa  170  8e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2043  methyl-accepting chemotaxis protein  26.63 
 
 		 660 aa  170  8e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000331062 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0469  methyl-accepting chemotaxis protein  31.07 
 
 		 658 aa  169  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.683606  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1837  methyl-accepting chemotaxis protein  25.75 
 
 		 660 aa  169  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1328  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  26.47 
 
 		 658 aa  170  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0614  methyl-accepting chemotaxis protein  29.93 
 
 		 658 aa  169  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0526  methyl-accepting chemotaxis protein  31.07 
 
 		 658 aa  169  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0631  methyl-accepting chemotaxis protein  30.12 
 
 		 660 aa  169  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0558  methyl-accepting chemotaxis protein  31.07 
 
 		 658 aa  169  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.71 
 
 		 660 aa  169  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1871  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  28.46 
 
 		 660 aa  169  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2122  methyl-accepting chemotaxis protein  26.19 
 
 		 660 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0594  methyl-accepting chemotaxis protein  31.31 
 
 		 658 aa  167  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1266  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.8 
 
 		 822 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0493  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.02 
 
 		 726 aa  164  4.0000000000000004e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3136  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.83 
 
 		 678 aa  164  5.0000000000000005e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000886233  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4841  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25.7 
 
 		 666 aa  164  7e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0619  methyl-accepting chemotaxis protein  30.41 
 
 		 658 aa  163  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2088  methyl-accepting chemotaxis protein  26.53 
 
 		 660 aa  163  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.35017  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4745  methyl-accepting chemotaxis protein  29.5 
 
 		 658 aa  163  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3282  methyl-accepting chemotaxis protein  30.22 
 
 		 660 aa  162  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3206  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.22 
 
 		 729 aa  162  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  27.55 
 
 		 658 aa  162  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0687  methyl-accepting chemotaxis protein  29.76 
 
 		 658 aa  161  5e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  23.54 
 
 		 695 aa  161  5e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0266885  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.66 
 
 		 762 aa  160  6e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000205913  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.25 
 
 		 561 aa  160  9e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03020  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.76 
 
 		 693 aa  160  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3056  methyl-accepting chemotaxis protein  30 
 
 		 650 aa  159  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3291  methyl-accepting chemotaxis protein  30 
 
 		 650 aa  159  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.279097  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1008  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.41 
 
 		 574 aa  159  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.41 
 
 		 551 aa  159  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2112  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 571 aa  159  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1878  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.79 
 
 		 717 aa  158  3e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000811489  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1639  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.78 
 
 		 566 aa  158  3e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00481169  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3533  methyl-accepting chemotaxis protein  28.44 
 
 		 660 aa  158  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0516  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.79 
 
 		 664 aa  157  7e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0344435  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3234  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.95 
 
 		 678 aa  156  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0897525  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5156  methyl-accepting chemotaxis protein  24.76 
 
 		 666 aa  155  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.99909  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0088  methyl-accepting chemotaxis protein  24.76 
 
 		 666 aa  156  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0338  methyl-accepting chemotaxis protein  30.83 
 
 		 574 aa  155  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0832369  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0341  methyl-accepting chemotaxis protein  30.83 
 
 		 574 aa  155  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00480  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.71 
 
 		 676 aa  154  4e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0355  methyl-accepting chemotaxis protein  29.6 
 
 		 574 aa  155  4e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0016  methyl-accepting chemotaxis protein  28.69 
 
 		 660 aa  155  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0369  methyl-accepting chemotaxis protein  29.6 
 
 		 574 aa  155  4e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.631563  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3605  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.97 
 
 		 666 aa  154  5e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1699  methyl-accepting chemotaxis protein  26.69 
 
 		 660 aa  154  7e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.606414  hitchhiker  0.000000000000351139 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5124  methyl-accepting chemotaxis protein  27.56 
 
 		 669 aa  154  8e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4724  methyl-accepting chemotaxis protein  27.56 
 
 		 666 aa  153  8.999999999999999e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4882  methyl-accepting chemotaxis protein  27.56 
 
 		 666 aa  153  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2273  methyl-accepting chemotaxis protein  29.88 
 
 		 650 aa  153  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.487735  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  28.17 
 
 		 658 aa  153  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5256  methyl-accepting chemotaxis protein  27.56 
 
 		 666 aa  153  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0594583  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.59 
 
 		 566 aa  153  1e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19740  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.22 
 
 		 667 aa  152  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0078  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  28.43 
 
 		 588 aa  151  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.857462  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3156  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.36 
 
 		 416 aa  151  4e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000160053  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20990  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26 
 
 		 654 aa  151  5e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000706955  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2579  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  28.89 
 
 		 678 aa  150  6e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5151  methyl-accepting chemotaxis protein  23.66 
 
 		 666 aa  150  7e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4739  methyl-accepting chemotaxis protein  26.93 
 
 		 666 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2663  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.67 
 
 		 418 aa  149  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.457369  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.82 
 
 		 566 aa  148  4.0000000000000006e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00082247  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5162  methyl-accepting chemotaxis protein  27.44 
 
 		 666 aa  148  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0389  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.41 
 
 		 587 aa  147  7.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.074674  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1610  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.13 
 
 		 572 aa  147  7.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0355909  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4750  chemotaxis signal transducer  28.53 
 
 		 563 aa  147  8.000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000451458  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5150  chemotaxis signal transducer  28.53 
 
 		 563 aa  147  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000223621 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4769  methyl-accepting chemotaxis protein  28.53 
 
 		 563 aa  147  9e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000157203  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0749  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.84 
 
 		 657 aa  146  1e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.388814  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0079  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  27.45 
 
 		 588 aa  147  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.031352  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0401  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.75 
 
 		 755 aa  146  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00237245  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5195  methyl-accepting chemotaxis protein  28.27 
 
 		 563 aa  146  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>