144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0837 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0837  hypothetical protein  100 
 
 
134 aa  262  1e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000105699  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1908  protein of unknown function DUF322  82.05 
 
 
127 aa  191  3e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1533  hypothetical protein  70.83 
 
 
135 aa  178  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.732766  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1523  hypothetical protein  67.44 
 
 
137 aa  169  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000646424  normal  0.0376642 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1282  protein of unknown function DUF322  66.1 
 
 
133 aa  154  5.0000000000000005e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000067785  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3506  protein of unknown function DUF322  64.29 
 
 
132 aa  153  9e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000443338  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06270  hypothetical protein  70.75 
 
 
132 aa  152  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000136905  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1108  protein of unknown function DUF322  66.38 
 
 
130 aa  142  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000124117  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1066  hypothetical protein  64.17 
 
 
137 aa  137  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000039435  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1017  hypothetical protein  67.59 
 
 
132 aa  135  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325612  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0998  protein of unknown function DUF322  70.59 
 
 
128 aa  124  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000173041  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0561  hypothetical protein  49.17 
 
 
134 aa  117  7e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000106209  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2516  hypothetical protein  50 
 
 
130 aa  107  4.0000000000000004e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.55961  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2876  hypothetical protein  45.97 
 
 
130 aa  105  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0976697  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1761  protein of unknown function DUF322  51.89 
 
 
126 aa  104  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.223537 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1186  hypothetical protein  45.54 
 
 
145 aa  104  4e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00330637  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0245  protein of unknown function DUF322  48.6 
 
 
133 aa  104  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2326  protein of unknown function DUF322  42.24 
 
 
131 aa  102  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000599295  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3838  protein of unknown function DUF322  47.75 
 
 
118 aa  101  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.55923e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1138  protein of unknown function DUF322  42.86 
 
 
142 aa  97.8  4e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000000668852  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1783  protein of unknown function DUF322  45.97 
 
 
148 aa  97.4  6e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1344  protein of unknown function DUF322  47.71 
 
 
119 aa  97.4  6e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.635847  normal  0.332386 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8027  hypothetical protein  45.32 
 
 
165 aa  96.7  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206185  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4065  protein of unknown function DUF322  41.54 
 
 
155 aa  94.4  6e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1073  protein of unknown function DUF322  47.22 
 
 
120 aa  94  6e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.374803  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10090  hypothetical protein  45.05 
 
 
120 aa  94  6e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.10411e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2794  protein of unknown function DUF322  41.22 
 
 
166 aa  94  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.119411  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4256  hypothetical protein  46.28 
 
 
130 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4087  hypothetical protein  46.28 
 
 
130 aa  92.4  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.18348  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3925  hypothetical protein  46.28 
 
 
130 aa  92.4  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3936  hypothetical protein  46.28 
 
 
130 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.294026  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4407  hypothetical protein  46.28 
 
 
130 aa  92.4  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2213  alkaline shock protein 23  42.98 
 
 
169 aa  92.4  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2252  alkaline shock protein 23  42.98 
 
 
169 aa  92.4  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.795316  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4035  hypothetical protein  46.28 
 
 
130 aa  92.4  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4313  hypothetical protein  46.28 
 
 
130 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4293  hypothetical protein  46.28 
 
 
130 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0941  hypothetical protein  46.28 
 
 
130 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00995769 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4203  hypothetical protein  46.28 
 
 
130 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000323253 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2079  alkaline shock protein  40 
 
 
129 aa  89.7  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102163  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1793  alkaline shock protein  40 
 
 
129 aa  89.7  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0585534  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1782  alkaline shock protein 23  41.46 
 
 
166 aa  89  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.369118  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1963  protein of unknown function DUF322  44.44 
 
 
120 aa  89  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0290  protein of unknown function DUF322  43.61 
 
 
158 aa  89.4  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.502178  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1284  hypothetical protein  42.37 
 
 
124 aa  89.4  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132839  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1309  hypothetical protein  42.37 
 
 
124 aa  89.4  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00108865  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2659  protein of unknown function DUF322  41.8 
 
 
237 aa  88.2  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000270753  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2233  hypothetical protein  38.93 
 
 
152 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.340857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2280  hypothetical protein  38.93 
 
 
152 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.347152  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2272  hypothetical protein  38.93 
 
 
152 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.501801  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2509  hypothetical protein  42.59 
 
 
120 aa  87  7e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000137615  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3680  hypothetical protein  42.59 
 
 
120 aa  86.7  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000589805  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1222  protein of unknown function DUF322  43.64 
 
 
116 aa  87  9e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1705  protein of unknown function DUF322  38.39 
 
 
124 aa  86.7  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.989447  normal  0.278624 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3899  hypothetical protein  41.67 
 
 
120 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000032718  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3708  hypothetical protein  41.67 
 
 
120 aa  85.5  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000339782  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3598  hypothetical protein  41.67 
 
 
120 aa  85.5  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.6047e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3616  hypothetical protein  41.67 
 
 
120 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000485784  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3995  hypothetical protein  41.67 
 
 
120 aa  85.5  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000107112  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2628  protein of unknown function DUF322  39.84 
 
 
145 aa  85.5  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000769408  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3905  hypothetical protein  41.67 
 
 
120 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000704337  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3956  hypothetical protein  41.67 
 
 
120 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000150921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1287  hypothetical protein  41.67 
 
 
120 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000400047  hitchhiker  0.00000103089 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3871  hypothetical protein  41.67 
 
 
120 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.27475e-32 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2662  protein of unknown function DUF322  40 
 
 
124 aa  85.1  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000716199  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0791  hypothetical protein  40.68 
 
 
124 aa  84.7  4e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.967276  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0197  hypothetical protein  35.71 
 
 
144 aa  84.7  4e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000491203  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3258  protein of unknown function DUF322  39.2 
 
 
178 aa  84.3  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1595  protein of unknown function DUF322  38.24 
 
 
168 aa  83.6  8e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.521971  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3379  hypothetical protein  36.75 
 
 
149 aa  83.6  9e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0676436  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1617  hypothetical protein  36.21 
 
 
150 aa  83.2  0.000000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.109012  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3351  protein of unknown function DUF322  37.31 
 
 
166 aa  82.8  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.40456  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3467  protein of unknown function DUF322  41.94 
 
 
165 aa  83.2  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.865658 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4774  protein of unknown function DUF322  37.88 
 
 
167 aa  82.4  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.18923  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0413  protein of unknown function DUF322  37.19 
 
 
159 aa  81.3  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1505  hypothetical protein  36.04 
 
 
124 aa  80.1  0.00000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.453517  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0790  hypothetical protein  35.4 
 
 
127 aa  79.7  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.668683  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1040  protein of unknown function DUF322  37.82 
 
 
148 aa  79.7  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000237836  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1750  protein of unknown function DUF322  42.73 
 
 
138 aa  79.7  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3957  hypothetical protein  40.34 
 
 
161 aa  79  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.951058  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1986  hypothetical protein  36.28 
 
 
115 aa  79  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1704  hypothetical protein  36.28 
 
 
115 aa  79  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4348  hypothetical protein  37.98 
 
 
162 aa  79  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0313929  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0749  hypothetical protein  34.55 
 
 
148 aa  78.6  0.00000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00125864 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1855  alkaline-shock protein  36.61 
 
 
121 aa  78.6  0.00000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000204659  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0769  hypothetical protein  38.89 
 
 
120 aa  76.3  0.0000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  5.38931e-16  hitchhiker  0.0000000108029 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1135  gls24 protein, putative  37.4 
 
 
183 aa  75.5  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0111706  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27170  hypothetical protein  39.52 
 
 
164 aa  75.5  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.730577  normal  0.440149 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2266  protein of unknown function DUF322  47.67 
 
 
140 aa  75.5  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4994  protein of unknown function DUF322  44.44 
 
 
120 aa  75.1  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1164  hypothetical protein  40.57 
 
 
120 aa  75.1  0.0000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000269961  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2892  hypothetical protein  40.19 
 
 
118 aa  73.6  0.0000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000110692  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0130  hypothetical protein  35.19 
 
 
121 aa  73.2  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000409279  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0721  hypothetical protein  34.78 
 
 
133 aa  73.2  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.210577  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0774  hypothetical protein  37.5 
 
 
182 aa  72.8  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.28582  normal  0.234272 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2601  protein of unknown function DUF322  40.38 
 
 
119 aa  72.8  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00304774  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0366  hypothetical protein  32.77 
 
 
158 aa  72.8  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000405379  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0057  hypothetical protein  35 
 
 
189 aa  71.6  0.000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0617  protein of unknown function DUF322  33.91 
 
 
153 aa  71.6  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.208416 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09980  hypothetical protein  34.86 
 
 
115 aa  71.6  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000012497  hitchhiker  0.00000206234 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>