35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6224 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6224  WbqC-like family protein  100 
 
 		 210 aa  438  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2171  WbqC-like family protein  40.84 
 
 		 203 aa  158  7e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.547253 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0207  hypothetical protein  38 
 
 		 204 aa  143  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07090  hypothetical protein  38 
 
 		 206 aa  141  6e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.611715  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1809  WbqC-like family protein  38.12 
 
 		 207 aa  137  1e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1369  WbqC-like family protein  36.36 
 
 		 217 aa  135  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1999  hypothetical protein  35.1 
 
 		 212 aa  134  7.000000000000001e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.390702 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1077  hypothetical protein  33.65 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.196873 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0458  hypothetical protein  31.73 
 
 		 214 aa  106  3e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0464  hypothetical protein  31.73 
 
 		 214 aa  106  3e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5018  WbqC-like family protein  26.94 
 
 		 221 aa  86.7  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.249012  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5397  WbqC-like family protein  23.28 
 
 		 243 aa  74.7  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1134  WbqC-like family protein  25.23 
 
 		 227 aa  71.6  0.000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3335  hypothetical protein  29.17 
 
 		 240 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.600477 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0145  hypothetical protein  27.08 
 
 		 235 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0361  hypothetical protein  24.11 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1867  WbqC-like family protein  23.9 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3312  WbqC-like family protein  24.68 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0360006  normal  0.612167 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0158  WbqC-like family protein  26.39 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.87544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0167  hypothetical protein  21.74 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0238  WbqC-like family protein  22.87 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4402  hypothetical protein  24.32 
 
 		 237 aa  55.1  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2851  hypothetical protein  21.52 
 
 		 229 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000183641 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0302  WbqC-like family protein  25 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000985813  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5672  WbqC-like family protein  21.43 
 
 		 229 aa  52.8  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.397575  normal  0.0211731 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3120  hypothetical protein  24.26 
 
 		 231 aa  52  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0236113  hitchhiker  0.00120592 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0831  WbqC-like family protein  23.25 
 
 		 230 aa  51.6  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.064129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0285  hypothetical protein  30.69 
 
 		 242 aa  51.2  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.385074  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2744  hypothetical protein  23.85 
 
 		 249 aa  47.8  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.58693  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3212  WbnG  20.09 
 
 		 236 aa  45.4  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.578652  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0640  WbqC-like family protein  24.46 
 
 		 240 aa  43.9  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.636618  normal  0.417336 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1293  hypothetical protein  19.74 
 
 		 241 aa  42.4  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0505  WbqC-like family protein  27.54 
 
 		 209 aa  42  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000101608  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1218  WbqC-like family protein  24.14 
 
 		 246 aa  41.6  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3056  hypothetical protein  22.55 
 
 		 236 aa  41.6  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.495216  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>