44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5228 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_5228  metallophosphoesterase  100 
 
 
369 aa  771    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0838269 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1319  metallophosphoesterase  64.4 
 
 
406 aa  507  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0846  metallophosphoesterase  57.26 
 
 
371 aa  455  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.442383  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3690  metallophosphoesterase  49.45 
 
 
377 aa  384  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.93963  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1801  metallophosphoesterase  29.24 
 
 
517 aa  99.4  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.050773  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6679  hypothetical protein  26.86 
 
 
502 aa  79.7  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.207997  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_2983  predicted protein  29.33 
 
 
312 aa  62.8  0.000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.268797 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6374  metallophosphoesterase  26.03 
 
 
512 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12597  hypothetical protein  27.16 
 
 
529 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3335  metallophosphoesterase  26.64 
 
 
473 aa  57  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.375817 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0385  metallophosphoesterase  27.41 
 
 
701 aa  56.6  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00164005  normal  0.49014 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3838  metallophosphoesterase  30.4 
 
 
442 aa  56.2  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.58711 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0042  metallophosphoesterase  28.8 
 
 
774 aa  56.2  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0825488 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5806  metallophosphoesterase  26.46 
 
 
521 aa  55.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.737004  normal  0.176893 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2066  metallophosphoesterase  28.57 
 
 
686 aa  54.7  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1028  hypothetical protein  26.24 
 
 
394 aa  52.4  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.137155  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02360  acid phosphatase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00800)  27.24 
 
 
497 aa  50.1  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2351  metallophosphoesterase  27.32 
 
 
251 aa  50.1  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.908698  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2499  hypothetical protein  23.46 
 
 
297 aa  50.1  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1747  hypothetical protein  26.22 
 
 
1139 aa  50.1  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000564232 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2974  metallophosphoesterase  25.33 
 
 
643 aa  49.7  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.668826  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3007  metallophosphoesterase  27.67 
 
 
313 aa  49.7  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000150726 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5676  metallophosphoesterase  28.97 
 
 
326 aa  48.9  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0494432 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4283  metallophosphoesterase  21.53 
 
 
717 aa  48.9  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.227058  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1080  metallophosphoesterase  22.61 
 
 
659 aa  48.9  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0645361 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0692  metallophosphoesterase  32.12 
 
 
255 aa  47.8  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2893  Alkaline phosphatase  23.11 
 
 
452 aa  47.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21156  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2225  metallophosphoesterase  28.3 
 
 
522 aa  47.4  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12331  predicted protein  30 
 
 
314 aa  47.4  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2003  acid phosphatase  24.44 
 
 
309 aa  47  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0615  metallophosphoesterase  24.82 
 
 
680 aa  46.2  0.0008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3941  hypothetical protein  26.45 
 
 
579 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4749  metallophosphoesterase  28.07 
 
 
522 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_2761  predicted protein  25.66 
 
 
298 aa  45.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.399041  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0189  metallophosphoesterase  30 
 
 
515 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.326449 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3378  metallophosphoesterase  24.81 
 
 
449 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09660  Calcineurin-like phosphoesterase  25.33 
 
 
898 aa  43.9  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0235626  normal  0.450743 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5306  metallophosphoesterase  24.53 
 
 
295 aa  44.3  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1992  hypothetical protein  25.33 
 
 
521 aa  43.9  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1132  metallophosphoesterase  25.87 
 
 
305 aa  43.5  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3627  metallophosphoesterase  28.18 
 
 
525 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.542304  normal  0.580152 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2154  metallophosphoesterase  22.86 
 
 
1019 aa  43.9  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000106564  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1019  phosphohydrolase  22.82 
 
 
410 aa  43.1  0.008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7562  metallophosphoesterase  26.19 
 
 
298 aa  42.7  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.790874  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>