15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3941 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3941  hypothetical protein  100 
 
 		 579 aa  1197    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2179  hypothetical protein  52.76 
 
 		 590 aa  609  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.92082 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2336  hypothetical protein  53.03 
 
 		 590 aa  609  1e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4398  hypothetical protein  36.01 
 
 		 608 aa  286  7e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.5486  normal  0.0412393 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4017  hypothetical protein  35.31 
 
 		 605 aa  278  1e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3190  hypothetical protein  30.17 
 
 		 661 aa  235  2.0000000000000002e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000624567 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6300  calcineurin-like phosphoesterase family protein  29.41 
 
 		 549 aa  213  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1254  hypothetical protein  32.06 
 
 		 680 aa  191  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.702145  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1802  hypothetical protein  29.13 
 
 		 828 aa  109  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.326364  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1801  metallophosphoesterase  26.57 
 
 		 517 aa  80.5  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.050773  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6679  hypothetical protein  23.66 
 
 		 502 aa  74.7  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.207997  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1319  metallophosphoesterase  22.73 
 
 		 406 aa  49.7  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1163  metallophosphoesterase  23.59 
 
 		 696 aa  47  0.0009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3690  metallophosphoesterase  27.31 
 
 		 377 aa  46.2  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.93963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5228  metallophosphoesterase  26.45 
 
 		 369 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0838269 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>