13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2179 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2179  hypothetical protein  100 
 
 		 590 aa  1219    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.92082 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2336  hypothetical protein  99.32 
 
 		 590 aa  1211    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3941  hypothetical protein  52.76 
 
 		 579 aa  609  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4398  hypothetical protein  32.51 
 
 		 608 aa  249  1e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.5486  normal  0.0412393 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4017  hypothetical protein  31.87 
 
 		 605 aa  241  2e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6300  calcineurin-like phosphoesterase family protein  32.24 
 
 		 549 aa  237  4e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3190  hypothetical protein  28.52 
 
 		 661 aa  211  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000624567 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1254  hypothetical protein  35.73 
 
 		 680 aa  190  5e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.702145  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1802  hypothetical protein  26.18 
 
 		 828 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.326364  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1801  metallophosphoesterase  26.61 
 
 		 517 aa  79  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.050773  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6679  hypothetical protein  24.34 
 
 		 502 aa  74.3  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.207997  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1163  metallophosphoesterase  23.84 
 
 		 696 aa  54.3  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3690  metallophosphoesterase  23.62 
 
 		 377 aa  43.9  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.93963  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>