14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1254 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1254  hypothetical protein  100 
 
 
680 aa  1340    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.702145  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4017  hypothetical protein  37.7 
 
 
605 aa  337  3.9999999999999995e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4398  hypothetical protein  36.14 
 
 
608 aa  322  9.999999999999999e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.5486  normal  0.0412393 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6300  calcineurin-like phosphoesterase family protein  33.59 
 
 
549 aa  261  4e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3190  hypothetical protein  32.93 
 
 
661 aa  213  7.999999999999999e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000624567 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3941  hypothetical protein  29.33 
 
 
579 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2179  hypothetical protein  35.64 
 
 
590 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.92082 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2336  hypothetical protein  35.45 
 
 
590 aa  189  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1802  hypothetical protein  28.44 
 
 
828 aa  84.3  0.000000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.326364  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6679  hypothetical protein  23.42 
 
 
502 aa  56.2  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.207997  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0846  metallophosphoesterase  23.58 
 
 
371 aa  50.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.442383  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1801  metallophosphoesterase  21.56 
 
 
517 aa  48.9  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.050773  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1319  metallophosphoesterase  22 
 
 
406 aa  48.1  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0385  Ser/Thr protein phosphatase family protein family  30.71 
 
 
540 aa  45.8  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>