18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0846 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0846  metallophosphoesterase  100 
 
 
371 aa  776    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.442383  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5228  metallophosphoesterase  57.26 
 
 
369 aa  455  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0838269 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1319  metallophosphoesterase  55.86 
 
 
406 aa  442  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3690  metallophosphoesterase  55.43 
 
 
377 aa  403  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.93963  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1801  metallophosphoesterase  28.45 
 
 
517 aa  94.7  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.050773  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6679  hypothetical protein  27.12 
 
 
502 aa  75.5  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.207997  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_2983  predicted protein  29.82 
 
 
312 aa  55.1  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.268797 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12331  predicted protein  26.83 
 
 
314 aa  51.2  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1254  hypothetical protein  23.58 
 
 
680 aa  50.4  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.702145  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5306  metallophosphoesterase  26.21 
 
 
295 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3335  metallophosphoesterase  26.16 
 
 
473 aa  48.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.375817 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0385  metallophosphoesterase  22.92 
 
 
701 aa  47.4  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00164005  normal  0.49014 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1132  metallophosphoesterase  28.99 
 
 
305 aa  47.4  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12597  hypothetical protein  27.27 
 
 
529 aa  47  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2499  hypothetical protein  24.43 
 
 
297 aa  45.1  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0615  metallophosphoesterase  29.31 
 
 
680 aa  43.9  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1019  phosphohydrolase  26.4 
 
 
410 aa  43.1  0.008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4771  metallophosphoesterase  34 
 
 
518 aa  42.7  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>