19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4129 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_3596  hypothetical protein  32.93 
 
 		 1635 aa  816    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2518  hypothetical protein  32.99 
 
 		 1635 aa  818    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.189661  normal  0.373256 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4129  hypothetical protein  100 
 
 		 1675 aa  3464    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.3835  normal  0.157034 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1638  hypothetical protein  29.89 
 
 		 857 aa  144  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7811  hypothetical protein  25.83 
 
 		 817 aa  129  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3467  regulatory protein, LuxR  26.58 
 
 		 739 aa  113  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0929812 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3568  hypothetical protein  26.63 
 
 		 697 aa  104  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.44867 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7144  hypothetical protein  26.76 
 
 		 811 aa  99.4  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1930  hypothetical protein  25.59 
 
 		 852 aa  98.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.476426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1935  hypothetical protein  27.1 
 
 		 837 aa  92.4  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.273514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3551  hypothetical protein  24.24 
 
 		 670 aa  73.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0236032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4075  hypothetical protein  22.96 
 
 		 634 aa  72  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.130051 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1890  hypothetical protein  26.19 
 
 		 1104 aa  66.2  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5697  hypothetical protein  26.9 
 
 		 802 aa  62.4  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1888  WGR domain-containing protein  23.99 
 
 		 1099 aa  59.3  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.735495  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6953  hypothetical protein  26.83 
 
 		 725 aa  58.2  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.448128  normal  0.626872 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2909  hypothetical protein  30.91 
 
 		 1116 aa  53.9  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.011304  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1889  WGR domain-containing protein  26.5 
 
 		 1086 aa  53.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00599399  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4309  hypothetical protein  27.73 
 
 		 1055 aa  52  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>