26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3392 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_3392  Lantibiotic dehydratase domain protein  100 
 
 
1042 aa  2174    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0262468  normal  0.618003 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1436  Lantibiotic dehydratase domain protein  36.4 
 
 
1038 aa  651    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0556  Lantibiotic dehydratase domain protein  42.63 
 
 
757 aa  619  1e-176  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.111003 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0066  Lantibiotic dehydratase domain protein  32.15 
 
 
1148 aa  552  1e-155  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.433774 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4704  Lantibiotic dehydratase domain protein  32.82 
 
 
1060 aa  548  1e-154  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0903  Lantibiotic dehydratase domain protein  34.78 
 
 
1036 aa  540  9.999999999999999e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4714  Lantibiotic dehydratase domain protein  33.61 
 
 
1055 aa  496  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2131  Lantibiotic dehydratase domain protein  30.88 
 
 
1013 aa  414  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0879912  normal  0.662037 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0557  hypothetical protein  40.88 
 
 
317 aa  226  2e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.351374 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4694  Lantibiotic dehydratase domain protein  26.52 
 
 
987 aa  132  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.908748  normal  0.810572 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1127  lantibiotic dehydratase-like  24.55 
 
 
1029 aa  132  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5417  Lantibiotic dehydratase domain-containing protein  23.26 
 
 
968 aa  128  6e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.944486 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1821  lantibiotic dehydratase-like  24.09 
 
 
1074 aa  115  5e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.525811  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3602  Lantibiotic dehydratase domain-containing protein  22.87 
 
 
964 aa  110  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.22565 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4647  Lantibiotic dehydratase domain protein  22.6 
 
 
1042 aa  109  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0056  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  23.34 
 
 
1035 aa  107  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2799  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  21.4 
 
 
1021 aa  94.7  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1332  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  27.78 
 
 
1066 aa  94.4  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.591859  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3315  lantibiotic dehydratase-like  21.6 
 
 
1027 aa  94  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.301651 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2033  lantibiotic dehydratase-like  26.2 
 
 
1031 aa  84.7  0.000000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423471  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6755  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  25.76 
 
 
915 aa  78.2  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0602  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  23.57 
 
 
1009 aa  69.3  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3936  Lantibiotic dehydratase domain protein  23.46 
 
 
729 aa  59.3  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139143  normal  0.0810168 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3692  Lantibiotic dehydratase domain protein  26.72 
 
 
904 aa  49.3  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1491  hypothetical protein  23.39 
 
 
357 aa  48.9  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.197933 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3530  hypothetical protein  30.65 
 
 
373 aa  44.7  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.212487 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>