156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2431 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_2431  endo-1,4-beta-xylanase  100 
 
 
291 aa  606  9.999999999999999e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0212534  normal  0.300404 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3031  hypothetical protein  55.97 
 
 
293 aa  305  4.0000000000000004e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3784  hypothetical protein  48.43 
 
 
303 aa  263  3e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000474919 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3062  esterase/lipase-like protein  33.12 
 
 
333 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.851787  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4918  putative esterase/lipase precursor  35.35 
 
 
299 aa  153  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.220535  normal  0.753644 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5554  xylanase  31.99 
 
 
286 aa  149  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0342677 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4537  xylanase  36.07 
 
 
301 aa  147  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0664665  normal  0.680457 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0225  pectin acetylesterase  34.77 
 
 
324 aa  142  4e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0473386  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2001  xylanase  34.41 
 
 
301 aa  142  6e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.554874 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1345  alpha/beta hydrolase  30.89 
 
 
305 aa  142  8e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2905  xylanase  30.93 
 
 
333 aa  142  9e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.641285  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2025  Alpha/beta hydrolase  30.7 
 
 
301 aa  139  4.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3550  alpha/beta hydrolase  32.8 
 
 
306 aa  137  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0287748  normal  0.0185565 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1964  pectin acetylesterase  32.13 
 
 
308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.235642  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3894  esterase/lipase-like protein  33.1 
 
 
301 aa  133  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1902  pectin acetylesterase  32.99 
 
 
320 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.501568  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2195  pectin acetylesterase  31.99 
 
 
318 aa  132  5e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2402  hypothetical protein  32.85 
 
 
319 aa  131  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.344472  normal  0.50924 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2906  xylanase  32.09 
 
 
319 aa  129  7.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2039  pectin acetylesterase  29.74 
 
 
314 aa  129  8.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.773427  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1954  pectin acetylesterase  31.53 
 
 
308 aa  129  8.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0283  esterase/lipase  30.74 
 
 
303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.375027 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1417  esterase/lipase  32.82 
 
 
310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.131998  normal  0.895698 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1924  pectin acetylesterase  30.67 
 
 
319 aa  122  5e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000155025  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3521  esterase/lipase-like protein  31.27 
 
 
333 aa  120  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2345  hypothetical protein  33.22 
 
 
274 aa  119  6e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4266  esterase/lipase-like protein  30.04 
 
 
309 aa  116  5e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.401395  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1725  hypothetical protein  32.42 
 
 
308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000919  endo-1,4-beta-xylanase  29.37 
 
 
303 aa  113  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3038  hypothetical protein  31.72 
 
 
323 aa  112  9e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.463751  normal  0.555394 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1536  hypothetical protein  32.27 
 
 
314 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0743655 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2933  hypothetical protein  29.63 
 
 
342 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.131666 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3159  hypothetical protein  29.63 
 
 
342 aa  110  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.526515  normal  0.865494 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3552  hypothetical protein  29.97 
 
 
328 aa  109  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1805  Esterase/lipase  32.6 
 
 
281 aa  108  9.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.90276  hitchhiker  0.0000000160109 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0788  esterase/lipase-like  32.06 
 
 
305 aa  108  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.155303  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2213  esterase/lipase-like protein  31.76 
 
 
267 aa  108  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000722209  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3115  hypothetical protein  30 
 
 
342 aa  106  6e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3975  hypothetical protein  28.48 
 
 
289 aa  104  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1651  hypothetical protein  30.83 
 
 
339 aa  103  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.744803  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0088  hypothetical protein  29.53 
 
 
337 aa  103  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0181  hypothetical protein  28.95 
 
 
329 aa  103  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.799105  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1129  putative acetylesterase  28.03 
 
 
328 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2271  alpha/beta hydrolase  28.97 
 
 
325 aa  101  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01948  xylanase  30.25 
 
 
249 aa  101  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1921  hypothetical protein  28.84 
 
 
327 aa  100  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0965  hypothetical protein  29.32 
 
 
337 aa  100  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0612  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  28.12 
 
 
326 aa  98.2  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.936989  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  29.27 
 
 
326 aa  98.6  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.984034  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3216  hypothetical protein  30.12 
 
 
317 aa  98.6  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.476052  normal  0.948257 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1044  putative acetylesterase  28.12 
 
 
326 aa  97.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.475385  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2345  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  28.12 
 
 
417 aa  97.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0855  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  28.12 
 
 
404 aa  97.4  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1292  hypothetical protein  27.07 
 
 
353 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10535  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0810  hypothetical protein  29.17 
 
 
275 aa  87.4  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0188  Esterase/lipase-like protein  22.46 
 
 
346 aa  84.7  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.871358 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2181  putative lipase/esterase  30.21 
 
 
258 aa  80.5  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000144182 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2427  endo-1,4-beta-xylanase B  28.02 
 
 
270 aa  79.7  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.740371  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1712  esterase/lipase-like protein  26.07 
 
 
334 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1475  esterase/lipase  23.33 
 
 
277 aa  72.8  0.000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0485  esterase/lipase  25.51 
 
 
255 aa  68.9  0.00000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1260  lipase/esterase family protein  23.92 
 
 
280 aa  66.2  0.0000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119975 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0661  esterase/lipase-like protein  27.4 
 
 
371 aa  65.9  0.0000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0519166  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0112  esterase/lipase  25.21 
 
 
272 aa  63.9  0.000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  7.81923e-16 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1216  putative esterase  26.44 
 
 
287 aa  63.2  0.000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.274462  normal  0.128321 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3014  acetyl esterase  26.03 
 
 
277 aa  63.2  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0258039  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01320  conserved hypothetical protein  29.58 
 
 
255 aa  61.6  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000546639  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4378  Esterase/lipase-like protein  23.91 
 
 
317 aa  59.3  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.222485 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0809  xylanase  29.91 
 
 
262 aa  58.5  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1549  esterase/lipase-like protein  24.18 
 
 
238 aa  58.5  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0449  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.75 
 
 
321 aa  58.2  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3795  esterase/lipase  27.78 
 
 
300 aa  57  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.662401  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5130  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  35.16 
 
 
279 aa  56.6  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.957663  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1433  exported protein precursor  37.72 
 
 
326 aa  56.2  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0486  Pectinesterase  35.34 
 
 
644 aa  55.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.536234  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1585  dienelactone hydrolase  33.86 
 
 
323 aa  54.7  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.144212  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3898  hypothetical protein  26.34 
 
 
358 aa  54.3  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0436  Esterase/lipase-like protein  33.62 
 
 
340 aa  53.5  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3240  hypothetical protein  24.34 
 
 
333 aa  53.1  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4253  esterase/lipase-like protein  23.96 
 
 
318 aa  53.5  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172615  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5462  esterase/lipase/thioesterase  29.71 
 
 
311 aa  52  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536989  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3171  Esterase/lipase-like protein  35.79 
 
 
359 aa  52  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1562  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.32 
 
 
293 aa  52  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1241  putative lipoprotein  33.33 
 
 
328 aa  52  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.045623 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0015  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.21 
 
 
344 aa  50.8  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2516  Esterase/lipase-like protein  26.48 
 
 
329 aa  51.6  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.228669  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1856  hypothetical protein  27.97 
 
 
321 aa  50.1  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4383  esterase/lipase/thioesterase family protein  26.52 
 
 
300 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2267  putative esterase/lipase  27.91 
 
 
321 aa  49.7  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.170928 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2672  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.41 
 
 
309 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.795558  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3220  hypothetical protein  24.19 
 
 
336 aa  49.3  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.46717  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4843  esterase/lipase/thioesterase family protein  25.33 
 
 
302 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1801  hypothetical protein  30.19 
 
 
334 aa  48.5  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2931  Esterase/lipase-like protein  39.29 
 
 
311 aa  48.9  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2205  hypothetical protein  30.19 
 
 
322 aa  48.5  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.900633 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1910  hypothetical protein  30.19 
 
 
334 aa  48.5  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.810251  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1454  esterase/lipase/thioesterase  26.32 
 
 
411 aa  48.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0950589  hitchhiker  0.0024577 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3735  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.49 
 
 
310 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0759445 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1935  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.47 
 
 
319 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0879113  normal  0.508771 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4391  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  27.78 
 
 
294 aa  48.1  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175517  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>