23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2152 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2152  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  100 
 
 		 227 aa  470  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00286727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3671  haloacid dehalogenase-like hydrolase  39.7 
 
 		 231 aa  155  7e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1515  hydrolase  30.05 
 
 		 242 aa  92  6e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.127689 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2411  hydrolase  28.22 
 
 		 238 aa  90.1  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.683271 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04620  conserved hypothetical protein  26.47 
 
 		 487 aa  56.2  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.311368 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0418  HAD superfamily hydrolase  23.5 
 
 		 230 aa  51.2  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1987  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  25.67 
 
 		 230 aa  48.1  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0718  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.65 
 
 		 221 aa  46.6  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00000286264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1510  phosphoglycolate phosphatase  22.82 
 
 		 249 aa  45.1  0.0009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117992  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0482  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.89 
 
 		 213 aa  44.3  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2687  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  23 
 
 		 228 aa  43.5  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4411  HAD family hydrolase  25.11 
 
 		 224 aa  42.7  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.981308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4195  hydrolase  22.22 
 
 		 234 aa  43.1  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.953926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1678  HAD superfamily hydrolase  25.52 
 
 		 233 aa  42.7  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6102  HAD family hydrolase  24.62 
 
 		 224 aa  42.7  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.524869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1120  hydrolase  23.12 
 
 		 231 aa  42.4  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0460  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  22.11 
 
 		 230 aa  42.4  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1284  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  23.12 
 
 		 227 aa  42.4  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153215  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0292  HAD family hydrolase  22.47 
 
 		 222 aa  42.4  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402537  normal  0.982934 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6309  HAD family hydrolase  25.13 
 
 		 224 aa  42.4  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.403057 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0220  HAD family hydrolase  20.9 
 
 		 238 aa  42.4  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.208784 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6512  HAD family hydrolase  24.62 
 
 		 224 aa  42  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1317  HAD family hydrolase  24.62 
 
 		 224 aa  42  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.716581  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>