21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1593 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1593  Excinuclease ABC C subunit domain protein  100 
 
 		 95 aa  198  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.758459 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1944  Excinuclease ABC C subunit domain protein  42.68 
 
 		 84 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.752306 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0210  hypothetical protein  36 
 
 		 81 aa  52.4  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.101895  normal  0.644199 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1816  excinuclease ABC, C subunit-like protein  39.24 
 
 		 79 aa  52.4  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.406649 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0107  hypothetical protein  40 
 
 		 83 aa  51.2  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.629422 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0402  excinuclease ABC subunit C  36.71 
 
 		 78 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1158  excinuclease ABC subunit C  31.25 
 
 		 93 aa  47.4  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0062  Excinuclease ABC C subunit domain protein  36.71 
 
 		 78 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.330089  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1935  excinuclease ABC subunit C  34.88 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.517176  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0778  hypothetical protein  37.7 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.68184  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2479  excinuclease ABC subunit C  31.25 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0181  excinuclease ABC, C subunit domain protein  35.53 
 
 		 83 aa  42.7  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.191258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2486  excinuclease ABC subunit C  31.25 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2485  excinuclease ABC subunit C  31.25 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2484  excinuclease ABC subunit C  31.25 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2483  excinuclease ABC subunit C  31.25 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2482  excinuclease ABC subunit C  31.25 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2480  excinuclease ABC subunit C  31.25 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1103  excinuclease ABC subunit C  41.82 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1603  Excinuclease ABC C subunit domain protein  42.31 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000181458  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0800  O-methyltransferase  35.21 
 
 		 338 aa  40.8  0.006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000866383  hitchhiker  1.55907e-17 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>