42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3463 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3463  UvrB/UvrC protein  100 
 
 		 173 aa  352  1e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000125325  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1827  UvrB/UvrC protein  44.77 
 
 		 170 aa  134  8e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000280692  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1950  UvrB/UvrC protein  37.79 
 
 		 177 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0127215  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0833  UvrB/UvrC protein  40 
 
 		 171 aa  120  7e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000420974  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0144  UvrB/UvrC protein  38.92 
 
 		 175 aa  115  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0160  UvrB/UvrC protein  37.06 
 
 		 169 aa  116  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0074  UvrB/UvrC protein  38.29 
 
 		 182 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.525038  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0081  UvrB/UvrC protein  34.83 
 
 		 182 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00231542  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2742  UvrB/UvrC protein  36.46 
 
 		 173 aa  111  4.0000000000000004e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0178  UvrB/UvrC protein  39.66 
 
 		 170 aa  111  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0074  UvrB/UvrC protein  34.83 
 
 		 182 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0417571  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00850  UvrB/UvrC protein  40.57 
 
 		 170 aa  108  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.038021  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1791  UvrB/UvrC protein  39.77 
 
 		 168 aa  107  9.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261454  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0089  hypothetical protein  36.93 
 
 		 182 aa  105  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.84577e-49 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0109  hypothetical protein  37.29 
 
 		 182 aa  106  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000454963  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0075  nucleotide excision repair protein  36.93 
 
 		 182 aa  105  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.452997  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0076  UvrB/UvrC protein  36.93 
 
 		 182 aa  105  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.247563  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0079  hypothetical protein  36.93 
 
 		 182 aa  105  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0078  hypothetical protein  36.93 
 
 		 182 aa  105  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0792443  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0179  UvrB/UvrC protein  35.39 
 
 		 167 aa  105  4e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0077  UvrB/UvrC protein  31.64 
 
 		 182 aa  104  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0079  hypothetical protein  36.36 
 
 		 182 aa  102  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.148772  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0100  hypothetical protein  36.93 
 
 		 182 aa  103  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00596962  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0387  UvrB/UvrC protein  36.05 
 
 		 165 aa  102  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000814074  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0325  UvrB/UvrC protein  36.47 
 
 		 162 aa  102  4e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00358864  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5226  hypothetical protein  36.57 
 
 		 182 aa  101  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000128201  hitchhiker  4.7433e-20 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0253  UvrB/UvrC protein  37.29 
 
 		 174 aa  99.8  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.552848 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2676  UvrB/UvrC protein  33.14 
 
 		 170 aa  90.9  7e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.712915  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0762  UvrB/UvrC protein  30.18 
 
 		 173 aa  80.1  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0331206  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2369  hypothetical protein  34.1 
 
 		 169 aa  79.3  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000515373  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1404  UvrB/UvrC protein  34.88 
 
 		 159 aa  77  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0057  UvrB/UvrC protein  26.92 
 
 		 178 aa  75.5  0.0000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00323429  normal  0.240627 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1084  Uncharacterized protein with conserved CXXC pairs-like protein  31.82 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.944063  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1482  UvrB/UvrC protein  27.75 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.051637  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2038  UVR domain-containing protein  29.12 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2439  hypothetical protein  29.31 
 
 		 175 aa  61.2  0.000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0163  UvrB/UvrC domain-containing protein  28.02 
 
 		 192 aa  60.8  0.000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2753  hypothetical protein  29.31 
 
 		 178 aa  60.5  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.105534  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0559  hypothetical protein  26.63 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0545  hypothetical protein  26.63 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0125  uncharacterized protein with conserved CXXC pairs  25.91 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.587234  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0312  ATPase AAA-2  45.71 
 
 		 803 aa  40.8  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>