46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2038 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2038  UVR domain-containing protein  100 
 
 		 165 aa  337  4e-92  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1950  UvrB/UvrC protein  28.22 
 
 		 177 aa  84  9e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0127215  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0179  UvrB/UvrC protein  26.51 
 
 		 167 aa  79  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1791  UvrB/UvrC protein  28.07 
 
 		 168 aa  78.2  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261454  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2742  UvrB/UvrC protein  26.74 
 
 		 173 aa  77.4  0.00000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0833  UvrB/UvrC protein  29.17 
 
 		 171 aa  77.4  0.00000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000420974  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0057  UvrB/UvrC protein  27.49 
 
 		 178 aa  74.7  0.0000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00323429  normal  0.240627 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0387  UvrB/UvrC protein  27.78 
 
 		 165 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000814074  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1482  UvrB/UvrC protein  32.5 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.051637  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1404  UvrB/UvrC protein  30.19 
 
 		 159 aa  70.9  0.000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0325  UvrB/UvrC protein  26.25 
 
 		 162 aa  70.5  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00358864  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0762  UvrB/UvrC protein  27.16 
 
 		 173 aa  69.3  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0331206  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0253  UvrB/UvrC protein  25.88 
 
 		 174 aa  69.3  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.552848 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1827  UvrB/UvrC protein  27.11 
 
 		 170 aa  68.9  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000280692  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2369  hypothetical protein  31.95 
 
 		 169 aa  68.9  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000515373  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0074  UvrB/UvrC protein  26.44 
 
 		 182 aa  68.2  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0417571  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0160  UvrB/UvrC protein  23.64 
 
 		 169 aa  67.4  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0545  hypothetical protein  25 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0559  hypothetical protein  25 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0144  UvrB/UvrC protein  24.71 
 
 		 175 aa  65.9  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3463  UvrB/UvrC protein  29.12 
 
 		 173 aa  63.2  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000125325  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00850  UvrB/UvrC protein  28.31 
 
 		 170 aa  63.5  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.038021  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0178  UvrB/UvrC protein  23.21 
 
 		 170 aa  61.6  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0074  UvrB/UvrC protein  22.67 
 
 		 182 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.525038  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0163  UvrB/UvrC domain-containing protein  25.81 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0081  UvrB/UvrC protein  23.84 
 
 		 182 aa  58.2  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00231542  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0100  hypothetical protein  22.73 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00596962  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0077  UvrB/UvrC protein  24.42 
 
 		 182 aa  54.3  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5226  hypothetical protein  24.29 
 
 		 182 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000128201  hitchhiker  4.7433e-20 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0079  hypothetical protein  24.16 
 
 		 182 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.148772  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0109  hypothetical protein  23.6 
 
 		 182 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000454963  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0075  nucleotide excision repair protein  24.16 
 
 		 182 aa  52  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.452997  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0089  hypothetical protein  24.16 
 
 		 182 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.84577e-49 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0079  hypothetical protein  24.16 
 
 		 182 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2439  hypothetical protein  24.86 
 
 		 175 aa  52.4  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0078  hypothetical protein  24.16 
 
 		 182 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0792443  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0076  UvrB/UvrC protein  24.16 
 
 		 182 aa  52  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.247563  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2676  UvrB/UvrC protein  23.75 
 
 		 170 aa  50.4  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.712915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2753  hypothetical protein  23.12 
 
 		 178 aa  47.8  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.105534  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1084  Uncharacterized protein with conserved CXXC pairs-like protein  20.69 
 
 		 182 aa  45.1  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.944063  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1827  excinuclease ABC subunit B  38.98 
 
 		 683 aa  43.1  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.54987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2520  excinuclease ABC subunit C  45.1 
 
 		 635 aa  43.1  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0047  hypothetical protein  25.42 
 
 		 177 aa  41.2  0.006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0283317  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0125  uncharacterized protein with conserved CXXC pairs  24.08 
 
 		 193 aa  41.2  0.007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.587234  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0668  protein of unknown function DUF151  63.64 
 
 		 197 aa  41.2  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2859  excinuclease ABC subunit C  42.59 
 
 		 623 aa  40.8  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.41177  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>