41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1791 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_1791  UvrB/UvrC protein  100 
 
 
168 aa  346  7e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261454  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0325  UvrB/UvrC protein  49.7 
 
 
162 aa  172  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00358864  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0144  UvrB/UvrC protein  45.4 
 
 
175 aa  169  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0833  UvrB/UvrC protein  48.21 
 
 
171 aa  167  6e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000420974  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1827  UvrB/UvrC protein  45.73 
 
 
170 aa  166  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000280692  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0179  UvrB/UvrC protein  40.49 
 
 
167 aa  151  2.9999999999999998e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0081  UvrB/UvrC protein  43.86 
 
 
182 aa  151  4e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00231542  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0160  UvrB/UvrC protein  44.31 
 
 
169 aa  149  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0253  UvrB/UvrC protein  42.11 
 
 
174 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.552848 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2742  UvrB/UvrC protein  39.88 
 
 
173 aa  143  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0178  UvrB/UvrC protein  43.37 
 
 
170 aa  140  6e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0074  UvrB/UvrC protein  41.28 
 
 
182 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0417571  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00850  UvrB/UvrC protein  44.51 
 
 
170 aa  138  3.9999999999999997e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.038021  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0387  UvrB/UvrC protein  43.56 
 
 
165 aa  137  6e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000814074  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0100  hypothetical protein  40.46 
 
 
182 aa  134  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00596962  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0077  UvrB/UvrC protein  40 
 
 
182 aa  134  7.000000000000001e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0076  UvrB/UvrC protein  39.88 
 
 
182 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.247563  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0075  nucleotide excision repair protein  40.12 
 
 
182 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.452997  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0089  hypothetical protein  40.12 
 
 
182 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.84577e-49 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5226  hypothetical protein  41.86 
 
 
182 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000128201  hitchhiker  4.7433e-20 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0109  hypothetical protein  39.88 
 
 
182 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000454963  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0079  hypothetical protein  40.12 
 
 
182 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0078  hypothetical protein  40.12 
 
 
182 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0792443  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1950  UvrB/UvrC protein  41.1 
 
 
177 aa  132  3e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0127215  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0079  hypothetical protein  40.12 
 
 
182 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.148772  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0074  UvrB/UvrC protein  40.35 
 
 
182 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.525038  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2369  hypothetical protein  41.32 
 
 
169 aa  116  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000515373  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3463  UvrB/UvrC protein  39.77 
 
 
173 aa  107  8.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000125325  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2676  UvrB/UvrC protein  37.18 
 
 
170 aa  103  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.712915  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0057  UvrB/UvrC protein  32.54 
 
 
178 aa  96.7  1e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00323429  normal  0.240627 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0762  UvrB/UvrC protein  32.93 
 
 
173 aa  92.4  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0331206  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1404  UvrB/UvrC protein  31.14 
 
 
159 aa  90.9  8e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0163  UvrB/UvrC domain-containing protein  26.23 
 
 
192 aa  81.3  0.000000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2439  hypothetical protein  29.01 
 
 
175 aa  80.5  0.000000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0559  hypothetical protein  28.49 
 
 
188 aa  80.5  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0545  hypothetical protein  28.49 
 
 
188 aa  80.5  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2753  hypothetical protein  29.01 
 
 
178 aa  80.1  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.105534  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2038  UVR domain-containing protein  28.07 
 
 
165 aa  78.2  0.00000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1084  Uncharacterized protein with conserved CXXC pairs-like protein  28.65 
 
 
182 aa  77  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.944063  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1482  UvrB/UvrC protein  41.76 
 
 
145 aa  65.5  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.051637  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0125  uncharacterized protein with conserved CXXC pairs  27.37 
 
 
193 aa  58.5  0.00000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.587234  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>