42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0325 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0325  UvrB/UvrC protein  100 
 
 		 162 aa  335  9.999999999999999e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00358864  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1791  UvrB/UvrC protein  49.7 
 
 		 168 aa  172  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261454  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1827  UvrB/UvrC protein  46.34 
 
 		 170 aa  166  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000280692  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0160  UvrB/UvrC protein  41.25 
 
 		 169 aa  145  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0833  UvrB/UvrC protein  41.67 
 
 		 171 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000420974  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0144  UvrB/UvrC protein  42.2 
 
 		 175 aa  144  5e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0081  UvrB/UvrC protein  43.35 
 
 		 182 aa  144  6e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00231542  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00850  UvrB/UvrC protein  45.73 
 
 		 170 aa  143  9e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.038021  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0074  UvrB/UvrC protein  40.7 
 
 		 182 aa  140  5e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0417571  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1950  UvrB/UvrC protein  42.24 
 
 		 177 aa  140  6e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0127215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0076  UvrB/UvrC protein  37.36 
 
 		 182 aa  135  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.247563  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5226  hypothetical protein  37.36 
 
 		 182 aa  135  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000128201  hitchhiker  4.7433e-20 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0078  hypothetical protein  37.79 
 
 		 182 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0792443  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0079  hypothetical protein  37.79 
 
 		 182 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0075  nucleotide excision repair protein  37.79 
 
 		 182 aa  134  4e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.452997  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0100  hypothetical protein  37.36 
 
 		 182 aa  134  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00596962  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0089  hypothetical protein  37.79 
 
 		 182 aa  134  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.84577e-49 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0109  hypothetical protein  37.36 
 
 		 182 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000454963  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0079  hypothetical protein  37.21 
 
 		 182 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.148772  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0178  UvrB/UvrC protein  40.36 
 
 		 170 aa  131  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0253  UvrB/UvrC protein  38.32 
 
 		 174 aa  130  5e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.552848 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0074  UvrB/UvrC protein  37.71 
 
 		 182 aa  130  6e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.525038  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0179  UvrB/UvrC protein  37.42 
 
 		 167 aa  130  6.999999999999999e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0387  UvrB/UvrC protein  38.12 
 
 		 165 aa  127  6e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000814074  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2742  UvrB/UvrC protein  35.5 
 
 		 173 aa  126  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0077  UvrB/UvrC protein  38.64 
 
 		 182 aa  122  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2676  UvrB/UvrC protein  40.27 
 
 		 170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.712915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2369  hypothetical protein  38.79 
 
 		 169 aa  108  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000515373  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3463  UvrB/UvrC protein  36.47 
 
 		 173 aa  102  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000125325  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0057  UvrB/UvrC protein  33.33 
 
 		 178 aa  89.7  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00323429  normal  0.240627 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0762  UvrB/UvrC protein  30.06 
 
 		 173 aa  82.8  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0331206  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1404  UvrB/UvrC protein  31.68 
 
 		 159 aa  82  0.000000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0163  UvrB/UvrC domain-containing protein  28.89 
 
 		 192 aa  73.9  0.0000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0559  hypothetical protein  26.11 
 
 		 188 aa  71.2  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0545  hypothetical protein  26.11 
 
 		 188 aa  71.2  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2038  UVR domain-containing protein  26.25 
 
 		 165 aa  70.5  0.000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1084  Uncharacterized protein with conserved CXXC pairs-like protein  28.82 
 
 		 182 aa  69.3  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.944063  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1482  UvrB/UvrC protein  30.38 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.051637  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2439  hypothetical protein  26.79 
 
 		 175 aa  63.2  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2753  hypothetical protein  26.79 
 
 		 178 aa  63.2  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.105534  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0047  hypothetical protein  27.75 
 
 		 177 aa  49.7  0.00002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0283317  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1132  ATPase AAA-2 domain protein  38.1 
 
 		 846 aa  41.6  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.502514  normal  0.57149 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>