44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0178 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0178  UvrB/UvrC protein  100 
 
 
170 aa  351  2.9999999999999997e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0253  UvrB/UvrC protein  48.82 
 
 
174 aa  177  4e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.552848 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0144  UvrB/UvrC protein  49.14 
 
 
175 aa  169  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0179  UvrB/UvrC protein  47.65 
 
 
167 aa  160  6e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0160  UvrB/UvrC protein  46.82 
 
 
169 aa  156  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1950  UvrB/UvrC protein  45.83 
 
 
177 aa  156  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0127215  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1827  UvrB/UvrC protein  44.38 
 
 
170 aa  153  9e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000280692  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0081  UvrB/UvrC protein  42.61 
 
 
182 aa  144  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00231542  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0833  UvrB/UvrC protein  40.12 
 
 
171 aa  142  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000420974  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1791  UvrB/UvrC protein  43.37 
 
 
168 aa  140  6e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261454  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0074  UvrB/UvrC protein  39.55 
 
 
182 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0417571  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00850  UvrB/UvrC protein  43.53 
 
 
170 aa  134  8e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.038021  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0325  UvrB/UvrC protein  40.36 
 
 
162 aa  131  5e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00358864  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0387  UvrB/UvrC protein  40.24 
 
 
165 aa  130  7.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000814074  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2742  UvrB/UvrC protein  38.15 
 
 
173 aa  129  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0109  hypothetical protein  38.86 
 
 
182 aa  127  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000454963  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0077  UvrB/UvrC protein  37.5 
 
 
182 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0078  hypothetical protein  38.42 
 
 
182 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0792443  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0079  hypothetical protein  38.42 
 
 
182 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5226  hypothetical protein  38.98 
 
 
182 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000128201  hitchhiker  4.7433e-20 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0075  nucleotide excision repair protein  38.42 
 
 
182 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.452997  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0076  UvrB/UvrC protein  38.42 
 
 
182 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.247563  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0089  hypothetical protein  38.42 
 
 
182 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.84577e-49 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0079  hypothetical protein  39.33 
 
 
182 aa  125  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.148772  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0074  UvrB/UvrC protein  38.29 
 
 
182 aa  123  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.525038  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0100  hypothetical protein  37.71 
 
 
182 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00596962  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3463  UvrB/UvrC protein  39.66 
 
 
173 aa  111  5e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000125325  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2369  hypothetical protein  38.82 
 
 
169 aa  104  5e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000515373  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2676  UvrB/UvrC protein  35.15 
 
 
170 aa  100  9e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.712915  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0057  UvrB/UvrC protein  33.93 
 
 
178 aa  84.7  5e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00323429  normal  0.240627 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0762  UvrB/UvrC protein  30.86 
 
 
173 aa  78.6  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0331206  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1084  Uncharacterized protein with conserved CXXC pairs-like protein  28.65 
 
 
182 aa  77  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.944063  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1404  UvrB/UvrC protein  30.72 
 
 
159 aa  76.3  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0559  hypothetical protein  28.49 
 
 
188 aa  75.5  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0545  hypothetical protein  28.49 
 
 
188 aa  75.5  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2439  hypothetical protein  28.65 
 
 
175 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0163  UvrB/UvrC domain-containing protein  28.8 
 
 
192 aa  69.7  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1482  UvrB/UvrC protein  28.14 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.051637  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2753  hypothetical protein  28.65 
 
 
178 aa  67  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.105534  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0125  uncharacterized protein with conserved CXXC pairs  23.98 
 
 
193 aa  65.1  0.0000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.587234  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2038  UVR domain-containing protein  23.21 
 
 
165 aa  61.6  0.000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1363  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  40.54 
 
 
722 aa  43.5  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000152049 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0418  excinuclease ABC subunit B  32.05 
 
 
664 aa  41.2  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2080  excinuclease ABC subunit B  52.78 
 
 
670 aa  40.8  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>