41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2439 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_2439  hypothetical protein  100 
 
 
175 aa  342  2e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2753  hypothetical protein  96 
 
 
178 aa  329  1e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.105534  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0160  UvrB/UvrC protein  28.49 
 
 
169 aa  87  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1827  UvrB/UvrC protein  31.71 
 
 
170 aa  83.6  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000280692  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1950  UvrB/UvrC protein  29.31 
 
 
177 aa  83.2  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0127215  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0387  UvrB/UvrC protein  31.33 
 
 
165 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000814074  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1791  UvrB/UvrC protein  29.01 
 
 
168 aa  80.5  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261454  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00850  UvrB/UvrC protein  30.54 
 
 
170 aa  79  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.038021  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0144  UvrB/UvrC protein  30.46 
 
 
175 aa  78.6  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0833  UvrB/UvrC protein  30.59 
 
 
171 aa  77  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000420974  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0074  UvrB/UvrC protein  28.81 
 
 
182 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0417571  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0179  UvrB/UvrC protein  27.71 
 
 
167 aa  75.1  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0081  UvrB/UvrC protein  26.14 
 
 
182 aa  71.2  0.000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00231542  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1404  UvrB/UvrC protein  27.98 
 
 
159 aa  70.1  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0178  UvrB/UvrC protein  28.65 
 
 
170 aa  69.3  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0253  UvrB/UvrC protein  27.65 
 
 
174 aa  65.9  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.552848 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0762  UvrB/UvrC protein  28.07 
 
 
173 aa  65.9  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0331206  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0074  UvrB/UvrC protein  28.25 
 
 
182 aa  63.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.525038  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2369  hypothetical protein  29.66 
 
 
169 aa  63.2  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000515373  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0325  UvrB/UvrC protein  26.79 
 
 
162 aa  63.2  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00358864  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3463  UvrB/UvrC protein  29.31 
 
 
173 aa  61.2  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000125325  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2742  UvrB/UvrC protein  23.6 
 
 
173 aa  60.5  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0077  UvrB/UvrC protein  27.68 
 
 
182 aa  58.9  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0109  hypothetical protein  28.49 
 
 
182 aa  58.2  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000454963  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0078  hypothetical protein  26.55 
 
 
182 aa  57.8  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0792443  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0089  hypothetical protein  26.55 
 
 
182 aa  57.8  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.84577e-49 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0075  nucleotide excision repair protein  26.55 
 
 
182 aa  57.8  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.452997  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0076  UvrB/UvrC protein  26.55 
 
 
182 aa  58.2  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.247563  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0079  hypothetical protein  26.55 
 
 
182 aa  57.8  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0057  UvrB/UvrC protein  27.22 
 
 
178 aa  57.4  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00323429  normal  0.240627 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5226  hypothetical protein  27.12 
 
 
182 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000128201  hitchhiker  4.7433e-20 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0100  hypothetical protein  25.42 
 
 
182 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00596962  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0079  hypothetical protein  26.55 
 
 
182 aa  54.3  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.148772  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2676  UvrB/UvrC protein  26.01 
 
 
170 aa  53.1  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.712915  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2038  UVR domain-containing protein  24.86 
 
 
165 aa  52.4  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1482  UvrB/UvrC protein  27.88 
 
 
145 aa  50.8  0.000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.051637  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0545  hypothetical protein  26.4 
 
 
188 aa  50.4  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0559  hypothetical protein  26.4 
 
 
188 aa  50.4  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1084  Uncharacterized protein with conserved CXXC pairs-like protein  26.63 
 
 
182 aa  47  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.944063  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0125  uncharacterized protein with conserved CXXC pairs  25.13 
 
 
193 aa  43.5  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.587234  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0163  UvrB/UvrC domain-containing protein  32.61 
 
 
192 aa  42.4  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>