57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2742 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_2742  UvrB/UvrC protein  100 
 
 		 173 aa  357  3e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0833  UvrB/UvrC protein  45.66 
 
 		 171 aa  169  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000420974  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0144  UvrB/UvrC protein  45.14 
 
 		 175 aa  165  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0081  UvrB/UvrC protein  46.24 
 
 		 182 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00231542  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1827  UvrB/UvrC protein  43.53 
 
 		 170 aa  160  6e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000280692  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0160  UvrB/UvrC protein  49.7 
 
 		 169 aa  156  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0077  UvrB/UvrC protein  44.57 
 
 		 182 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0074  UvrB/UvrC protein  43.68 
 
 		 182 aa  144  7.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.525038  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1791  UvrB/UvrC protein  39.88 
 
 		 168 aa  143  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261454  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0074  UvrB/UvrC protein  42.29 
 
 		 182 aa  142  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0417571  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5226  hypothetical protein  43.43 
 
 		 182 aa  142  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000128201  hitchhiker  4.7433e-20 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00850  UvrB/UvrC protein  47.06 
 
 		 170 aa  142  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.038021  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0078  hypothetical protein  43.1 
 
 		 182 aa  141  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0792443  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0075  nucleotide excision repair protein  43.1 
 
 		 182 aa  141  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.452997  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0089  hypothetical protein  43.1 
 
 		 182 aa  141  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.84577e-49 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0076  UvrB/UvrC protein  43.1 
 
 		 182 aa  141  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.247563  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0079  hypothetical protein  43.1 
 
 		 182 aa  141  4e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1950  UvrB/UvrC protein  44.89 
 
 		 177 aa  140  8e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0127215  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0100  hypothetical protein  42.94 
 
 		 182 aa  140  9e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00596962  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0079  hypothetical protein  42.94 
 
 		 182 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.148772  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0109  hypothetical protein  42.94 
 
 		 182 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000454963  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0253  UvrB/UvrC protein  43.86 
 
 		 174 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.552848 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0179  UvrB/UvrC protein  41.18 
 
 		 167 aa  136  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0178  UvrB/UvrC protein  38.15 
 
 		 170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0325  UvrB/UvrC protein  35.5 
 
 		 162 aa  126  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00358864  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2676  UvrB/UvrC protein  39.88 
 
 		 170 aa  122  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.712915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0387  UvrB/UvrC protein  37.65 
 
 		 165 aa  121  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000814074  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3463  UvrB/UvrC protein  36.46 
 
 		 173 aa  111  4.0000000000000004e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000125325  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2369  hypothetical protein  38.95 
 
 		 169 aa  109  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000515373  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0057  UvrB/UvrC protein  37.65 
 
 		 178 aa  105  2e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00323429  normal  0.240627 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0762  UvrB/UvrC protein  33.33 
 
 		 173 aa  99.4  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0331206  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1404  UvrB/UvrC protein  36.84 
 
 		 159 aa  92.8  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0163  UvrB/UvrC domain-containing protein  27.89 
 
 		 192 aa  89.7  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0545  hypothetical protein  28.8 
 
 		 188 aa  88.2  6e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0559  hypothetical protein  28.8 
 
 		 188 aa  88.2  6e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2038  UVR domain-containing protein  26.74 
 
 		 165 aa  77.4  0.00000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1084  Uncharacterized protein with conserved CXXC pairs-like protein  21.97 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.944063  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0125  uncharacterized protein with conserved CXXC pairs  27.37 
 
 		 193 aa  67.8  0.00000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.587234  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2753  hypothetical protein  23.6 
 
 		 178 aa  60.1  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.105534  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2439  hypothetical protein  23.6 
 
 		 175 aa  60.5  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1482  UvrB/UvrC protein  23.56 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.051637  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2030  excinuclease ABC subunit B  38.46 
 
 		 690 aa  46.6  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0667365  normal  0.695875 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0312  ATPase AAA-2  56.76 
 
 		 803 aa  45.4  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1106  excinuclease ABC subunit B  48.84 
 
 		 705 aa  45.4  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.442429  normal  0.317752 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1363  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  45.71 
 
 		 722 aa  43.9  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000152049 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0454  excinuclease ABC subunit B  40.48 
 
 		 680 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.77141 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0648  ATP-dependent Clp protease  35.37 
 
 		 752 aa  43.1  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1196  excinuclease ABC subunit B  51.28 
 
 		 701 aa  43.5  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0181  ATPase  44.19 
 
 		 812 aa  43.1  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.551384  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0134  excinuclease ABC subunit B  45.83 
 
 		 662 aa  42.7  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0150  excinuclease ABC subunit B  45.83 
 
 		 662 aa  42.4  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00713104  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1948  ATPase AAA-2 domain protein  48.65 
 
 		 812 aa  42.7  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0130841  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1402  ATPase AAA-2 domain protein  37.74 
 
 		 819 aa  42  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.515013  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2366  excinuclease ABC subunit B  42.42 
 
 		 698 aa  42.4  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2156  ATPase  40.74 
 
 		 848 aa  42  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0668  protein of unknown function DUF151  61.11 
 
 		 197 aa  41.6  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2966  ATPase AAA-2 domain protein  47.37 
 
 		 842 aa  41.2  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00321823  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>