26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0125 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0125  uncharacterized protein with conserved CXXC pairs  100 
 
 		 193 aa  393  1e-109  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.587234  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1950  UvrB/UvrC protein  24.61 
 
 		 177 aa  68.2  0.00000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0127215  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2742  UvrB/UvrC protein  27.37 
 
 		 173 aa  67.8  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0178  UvrB/UvrC protein  23.98 
 
 		 170 aa  65.1  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1084  Uncharacterized protein with conserved CXXC pairs-like protein  25.4 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.944063  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0081  UvrB/UvrC protein  26.29 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00231542  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0387  UvrB/UvrC protein  29.23 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000814074  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0160  UvrB/UvrC protein  25.26 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1791  UvrB/UvrC protein  27.37 
 
 		 168 aa  58.5  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261454  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0057  UvrB/UvrC protein  24.47 
 
 		 178 aa  58.2  0.00000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00323429  normal  0.240627 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3463  UvrB/UvrC protein  25.91 
 
 		 173 aa  57.4  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000125325  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0077  UvrB/UvrC protein  24.87 
 
 		 182 aa  57.4  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0179  UvrB/UvrC protein  22.56 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0833  UvrB/UvrC protein  24.23 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000420974  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0144  UvrB/UvrC protein  24.23 
 
 		 175 aa  55.5  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1404  UvrB/UvrC protein  24.74 
 
 		 159 aa  53.5  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2676  UvrB/UvrC protein  22.34 
 
 		 170 aa  51.6  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.712915  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1827  UvrB/UvrC protein  24.74 
 
 		 170 aa  50.4  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000280692  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2369  hypothetical protein  25.93 
 
 		 169 aa  49.3  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000515373  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0074  UvrB/UvrC protein  22.16 
 
 		 182 aa  47.4  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0417571  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0253  UvrB/UvrC protein  24.35 
 
 		 174 aa  46.6  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.552848 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0545  hypothetical protein  22.05 
 
 		 188 aa  45.8  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0559  hypothetical protein  22.05 
 
 		 188 aa  45.8  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2439  hypothetical protein  25.13 
 
 		 175 aa  43.5  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2753  hypothetical protein  24.35 
 
 		 178 aa  42  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.105534  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2038  UVR domain-containing protein  24.08 
 
 		 165 aa  41.2  0.01  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>