47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1950 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_1950  UvrB/UvrC protein  100 
 
 		 177 aa  355  9.999999999999999e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0127215  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0178  UvrB/UvrC protein  45.83 
 
 		 170 aa  156  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0179  UvrB/UvrC protein  45.45 
 
 		 167 aa  152  2.9999999999999998e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0253  UvrB/UvrC protein  45.88 
 
 		 174 aa  150  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.552848 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0833  UvrB/UvrC protein  46.51 
 
 		 171 aa  149  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000420974  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1827  UvrB/UvrC protein  44.31 
 
 		 170 aa  145  3e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000280692  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0074  UvrB/UvrC protein  42.53 
 
 		 182 aa  144  6e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0417571  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0325  UvrB/UvrC protein  42.24 
 
 		 162 aa  140  7e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00358864  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2742  UvrB/UvrC protein  44.89 
 
 		 173 aa  140  9e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0160  UvrB/UvrC protein  45.71 
 
 		 169 aa  139  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0144  UvrB/UvrC protein  41.86 
 
 		 175 aa  138  3.9999999999999997e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0074  UvrB/UvrC protein  40.35 
 
 		 182 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.525038  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5226  hypothetical protein  40.12 
 
 		 182 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000128201  hitchhiker  4.7433e-20 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1791  UvrB/UvrC protein  41.1 
 
 		 168 aa  132  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261454  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0078  hypothetical protein  39.08 
 
 		 182 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0792443  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0075  nucleotide excision repair protein  39.08 
 
 		 182 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.452997  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0079  hypothetical protein  39.08 
 
 		 182 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0089  hypothetical protein  39.08 
 
 		 182 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.84577e-49 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0076  UvrB/UvrC protein  39.53 
 
 		 182 aa  131  5e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.247563  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0081  UvrB/UvrC protein  40.35 
 
 		 182 aa  131  5e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00231542  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0079  hypothetical protein  38.51 
 
 		 182 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.148772  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0109  hypothetical protein  38.37 
 
 		 182 aa  128  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000454963  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00850  UvrB/UvrC protein  45.29 
 
 		 170 aa  128  4.0000000000000003e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.038021  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0100  hypothetical protein  37.93 
 
 		 182 aa  127  6e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00596962  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3463  UvrB/UvrC protein  37.79 
 
 		 173 aa  126  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000125325  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0387  UvrB/UvrC protein  40.12 
 
 		 165 aa  121  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000814074  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2369  hypothetical protein  45.29 
 
 		 169 aa  115  3.9999999999999997e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000515373  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0077  UvrB/UvrC protein  39.77 
 
 		 182 aa  115  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0762  UvrB/UvrC protein  37.2 
 
 		 173 aa  104  8e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0331206  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2676  UvrB/UvrC protein  38.04 
 
 		 170 aa  103  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.712915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0057  UvrB/UvrC protein  32.95 
 
 		 178 aa  89.7  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00323429  normal  0.240627 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1404  UvrB/UvrC protein  37.89 
 
 		 159 aa  87  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2038  UVR domain-containing protein  28.22 
 
 		 165 aa  84  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2439  hypothetical protein  29.31 
 
 		 175 aa  83.2  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2753  hypothetical protein  29.14 
 
 		 178 aa  80.9  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.105534  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1482  UvrB/UvrC protein  28.83 
 
 		 145 aa  77.4  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.051637  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0163  UvrB/UvrC domain-containing protein  25.97 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1084  Uncharacterized protein with conserved CXXC pairs-like protein  22.4 
 
 		 182 aa  70.5  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.944063  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0559  hypothetical protein  26.11 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0545  hypothetical protein  26.11 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0125  uncharacterized protein with conserved CXXC pairs  24.61 
 
 		 193 aa  68.2  0.00000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.587234  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0047  hypothetical protein  25.57 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0283317  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1363  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  47.22 
 
 		 722 aa  48.5  0.00005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000152049 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0889  ATPase AAA-2 domain protein  35.62 
 
 		 725 aa  47.8  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000179007  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0578  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  25.6 
 
 		 748 aa  45.8  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0150  excinuclease ABC subunit B  30.77 
 
 		 662 aa  43.9  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00713104  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0134  excinuclease ABC subunit B  24.79 
 
 		 662 aa  42.4  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>