47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0081 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0081  UvrB/UvrC protein  100 
 
 		 182 aa  383  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00231542  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0077  UvrB/UvrC protein  79.67 
 
 		 182 aa  291  4e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0074  UvrB/UvrC protein  54.4 
 
 		 182 aa  207  9e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0417571  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0076  UvrB/UvrC protein  54.95 
 
 		 182 aa  204  5e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.247563  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0089  hypothetical protein  54.95 
 
 		 182 aa  204  6e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.84577e-49 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0075  nucleotide excision repair protein  54.95 
 
 		 182 aa  204  6e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.452997  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0079  hypothetical protein  54.95 
 
 		 182 aa  204  6e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.148772  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0079  hypothetical protein  54.95 
 
 		 182 aa  204  7e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0078  hypothetical protein  54.95 
 
 		 182 aa  204  7e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0792443  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0109  hypothetical protein  54.95 
 
 		 182 aa  203  1e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000454963  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5226  hypothetical protein  54.4 
 
 		 182 aa  202  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000128201  hitchhiker  4.7433e-20 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0074  UvrB/UvrC protein  53.85 
 
 		 182 aa  199  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.525038  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0100  hypothetical protein  52.2 
 
 		 182 aa  194  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00596962  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0144  UvrB/UvrC protein  54.55 
 
 		 175 aa  192  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0833  UvrB/UvrC protein  46.63 
 
 		 171 aa  166  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000420974  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0160  UvrB/UvrC protein  46.02 
 
 		 169 aa  165  2.9999999999999998e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00850  UvrB/UvrC protein  49.43 
 
 		 170 aa  163  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.038021  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2742  UvrB/UvrC protein  46.24 
 
 		 173 aa  162  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1827  UvrB/UvrC protein  43.75 
 
 		 170 aa  154  9e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000280692  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1791  UvrB/UvrC protein  43.86 
 
 		 168 aa  151  4e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261454  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0178  UvrB/UvrC protein  42.61 
 
 		 170 aa  144  5e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0325  UvrB/UvrC protein  43.35 
 
 		 162 aa  144  8.000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00358864  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0253  UvrB/UvrC protein  41.34 
 
 		 174 aa  142  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.552848 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0387  UvrB/UvrC protein  40.23 
 
 		 165 aa  136  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000814074  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1950  UvrB/UvrC protein  40.35 
 
 		 177 aa  131  5e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0127215  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0179  UvrB/UvrC protein  39.08 
 
 		 167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2369  hypothetical protein  45.03 
 
 		 169 aa  129  3e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000515373  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3463  UvrB/UvrC protein  34.83 
 
 		 173 aa  111  5e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000125325  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2676  UvrB/UvrC protein  32.57 
 
 		 170 aa  100  8e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.712915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0057  UvrB/UvrC protein  34.68 
 
 		 178 aa  95.9  3e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00323429  normal  0.240627 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0762  UvrB/UvrC protein  30.23 
 
 		 173 aa  89.7  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0331206  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1404  UvrB/UvrC protein  31.61 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0163  UvrB/UvrC domain-containing protein  27.68 
 
 		 192 aa  79  0.00000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0545  hypothetical protein  27.53 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0559  hypothetical protein  27.53 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1084  Uncharacterized protein with conserved CXXC pairs-like protein  26.82 
 
 		 182 aa  74.7  0.0000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.944063  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2439  hypothetical protein  26.14 
 
 		 175 aa  71.2  0.000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2753  hypothetical protein  25 
 
 		 178 aa  68.2  0.00000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.105534  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0125  uncharacterized protein with conserved CXXC pairs  26.29 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.587234  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0047  hypothetical protein  28.57 
 
 		 177 aa  59.7  0.00000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0283317  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2038  UVR domain-containing protein  23.84 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1482  UvrB/UvrC protein  24.12 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.051637  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1363  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  45.71 
 
 		 722 aa  47  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000152049 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0889  ATPase AAA-2 domain protein  34.72 
 
 		 725 aa  45.8  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000179007  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0648  ATP-dependent Clp protease  29.49 
 
 		 752 aa  43.9  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1327  ATPase  42.86 
 
 		 734 aa  42.4  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00363395  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0578  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  44.12 
 
 		 748 aa  42  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>