38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3162 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3162  regulatory protein, LuxR  100 
 
 		 107 aa  217  3e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1183  hypothetical protein  34.04 
 
 		 180 aa  62.8  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.332216  normal  0.338767 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0159  hypothetical protein  33.72 
 
 		 171 aa  61.6  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3387  hypothetical protein  34.12 
 
 		 184 aa  60.8  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2703  hypothetical protein  31.76 
 
 		 171 aa  58.2  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1640  hypothetical protein  40 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.949601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1620  hypothetical protein  40 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2463  hypothetical protein  40 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00862525  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1770  hypothetical protein  40 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1822  hypothetical protein  40 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0326  hypothetical protein  31.58 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.663922  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1845  hypothetical protein  40 
 
 		 254 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.964527  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1898  hypothetical protein  40 
 
 		 254 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00577202  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1590  hypothetical protein  40 
 
 		 254 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.866908  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1786  hypothetical protein  36.49 
 
 		 254 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1417  hypothetical protein  38.57 
 
 		 254 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.785272  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3558  hypothetical protein  38.03 
 
 		 254 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.384967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1971  hypothetical protein  30.53 
 
 		 178 aa  53.5  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1640  transcriptional regulator  35.71 
 
 		 254 aa  52.4  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19040  hypothetical protein  31.25 
 
 		 148 aa  50.8  0.000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0113  ArsR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 429 aa  50.4  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0296  transcriptional regulator, ArsR family  31.25 
 
 		 188 aa  49.7  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2948  hypothetical protein  31.33 
 
 		 190 aa  48.9  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2321  hypothetical protein  28.57 
 
 		 234 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1172  hypothetical protein  31.33 
 
 		 174 aa  49.3  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.423417  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0055  hypothetical protein  37.5 
 
 		 79 aa  48.9  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1761  hypothetical protein  27.5 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0310951  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0452  hypothetical protein  32.5 
 
 		 155 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.683451  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2627  hypothetical protein  30.68 
 
 		 199 aa  47.8  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1129  hypothetical protein  33.85 
 
 		 172 aa  47.4  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3702  ArsR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 196 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3484  hypothetical protein  27.96 
 
 		 182 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.280863  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4107  Protein of unknown function DUF2087  32.47 
 
 		 165 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.609156  normal  0.645 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1821  hypothetical protein  28.57 
 
 		 168 aa  44.3  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.912712  normal  0.374512 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2974  hypothetical protein  28.41 
 
 		 181 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.328088 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2803  ArsR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 216 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0453  hypothetical protein  29.79 
 
 		 186 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.597962  hitchhiker  0.00422239 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1115  hypothetical protein  31.58 
 
 		 101 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>