37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1808 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1808  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  100 
 
 		 71 aa  143  9e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.540024  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2866  2Fe-2S-binding domain-containing protein  51.56 
 
 		 71 aa  70.1  0.000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0554434  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2551  2Fe-2S-binding domain-containing protein  51.56 
 
 		 71 aa  70.1  0.000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0444  BFD-like iron-sulfur cluster-binding protein  42.86 
 
 		 57 aa  54.3  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0435  BFD-like iron-sulfur cluster-binding protein  42.86 
 
 		 57 aa  54.3  0.0000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0283  FAD dependent oxidoreductase  42.62 
 
 		 475 aa  52  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0221  iron-sulfur cluster-binding protein  46.67 
 
 		 61 aa  48.5  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0220  iron-sulfur cluster-binding protein  46.67 
 
 		 61 aa  48.1  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.297456  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4400  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  33.85 
 
 		 865 aa  44.3  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.3242  normal  0.0318219 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5797  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  33.85 
 
 		 860 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.871719 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4506  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  33.85 
 
 		 857 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4147  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  33.85 
 
 		 857 aa  43.9  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.385776  normal  0.0888504 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  37.74 
 
 		 960 aa  43.9  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5372  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  44.44 
 
 		 481 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.420802 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1552  FAD dependent oxidoreductase  34 
 
 		 494 aa  43.1  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.374477  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3537  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  42.22 
 
 		 481 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0414628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3936  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  33.85 
 
 		 867 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00309412  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0930  FAD dependent oxidoreductase  31.82 
 
 		 479 aa  43.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0776869  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3507  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  37.5 
 
 		 857 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.917816  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0338  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  30.77 
 
 		 851 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.309621  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1249  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  30.77 
 
 		 851 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.130905  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1665  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  30.77 
 
 		 851 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1754  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  30.77 
 
 		 851 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132112  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0082  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  30.77 
 
 		 851 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1344  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  34.48 
 
 		 865 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.451527  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0243  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  30.77 
 
 		 851 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.944133  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1086  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  30.77 
 
 		 851 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.521926  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  35.19 
 
 		 983 aa  42  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1375  FAD dependent oxidoreductase  30.77 
 
 		 461 aa  42  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.575431  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4260  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  38.46 
 
 		 837 aa  41.2  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00961758  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  35.19 
 
 		 984 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0747  pyridine nucleotide- disulphide oxidoreductase family protein  35.85 
 
 		 477 aa  40.8  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.606696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4818  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H-binding) large subunit precursor  30.77 
 
 		 853 aa  40.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.601986 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5659  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  33.85 
 
 		 854 aa  40.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.150409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4427  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  35.85 
 
 		 477 aa  40.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428597  normal  0.768911 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3869  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  33.85 
 
 		 850 aa  40.4  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.104514  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1222  nitrite reductase NADPH large subunit  32.31 
 
 		 852 aa  40.4  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.356268  normal  0.678128 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>