19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0932 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0932  polysaccharide lyase family protein 8  100 
 
 		 750 aa  1570    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0363871  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0786  polysaccharide lyase family 8  26.4 
 
 		 700 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3979  polysaccharide lyase family 8  22.34 
 
 		 718 aa  100  8e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3972  coagulation factor 5/8 type domain protein  22.55 
 
 		 929 aa  89.7  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.443016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4325  chondroitin AC lyase  26.17 
 
 		 693 aa  89  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7449  hypothetical protein  24.41 
 
 		 636 aa  73.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3227  Hyaluronate lyase  22.01 
 
 		 1131 aa  71.2  0.00000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2840  polysaccharide lyase family 8  24.64 
 
 		 989 aa  69.7  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.109346  normal  0.0108324 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1698  hyaluronate lyase  22.51 
 
 		 793 aa  66.2  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222511  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0500  polysaccharide lyase family 8  24.88 
 
 		 533 aa  64.3  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346359  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3863  Chondroitin AC lyase  23.4 
 
 		 656 aa  63.9  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.569924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4980  polysaccharide lyase 8 alpha-helical  19.66 
 
 		 797 aa  61.2  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00611188  normal  0.0115553 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0174  polysaccharide lyase 8 alpha-helical  22.37 
 
 		 846 aa  56.2  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0784  Lyase catalytic  20.66 
 
 		 1030 aa  54.7  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0850  Hyaluronate lyase  23.38 
 
 		 792 aa  48.9  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0390  polysaccharide lyase family protein 8  24.05 
 
 		 985 aa  47  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.918566  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2271  polysaccharide lyase family protein 8  24.55 
 
 		 809 aa  46.2  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2232  polysaccharide lyase family protein 8  24.55 
 
 		 809 aa  46.2  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0352  hyaluronate lyase  19.87 
 
 		 791 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>