30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0172 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0172  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 313 aa  637    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1554  XRE family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 310 aa  223  4e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4934  transcriptional regulator, XRE family  26.71 
 
 		 487 aa  62.8  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3542  helix-turn-helix domain-containing protein  26.82 
 
 		 442 aa  53.5  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.518975  normal  0.855489 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9326  putative transcriptional regulator, XRE family  26.86 
 
 		 452 aa  50.1  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.607046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0478  helix-turn-helix domain-containing protein  23.97 
 
 		 281 aa  49.3  0.00008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000308908  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2224  helix-turn-helix domain protein  41.38 
 
 		 403 aa  49.3  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.163485  hitchhiker  0.00213028 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2884  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 292 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.308835 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2129  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 		 264 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.862241  normal  0.041856 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2452  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 292 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0425  transcriptional regulator  32.73 
 
 		 297 aa  47  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.732449  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4288  transcriptional regulator, XRE family  41.07 
 
 		 297 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.492783  normal  0.641627 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1013  transcriptional regulator, XRE family  41.07 
 
 		 297 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0833138  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4129  transcriptional regulator, XRE family  40.74 
 
 		 298 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000159672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5529  putative transcriptional regulator PlcR  24.69 
 
 		 285 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1239  DNA-binding protein  40.74 
 
 		 294 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1315  transcriptional regulator, XRE family  40.74 
 
 		 300 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000145495  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1212  transcriptional regulator, XRE family  40.74 
 
 		 298 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.295347  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1271  DNA-binding protein  40.74 
 
 		 294 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00018946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1163  DNA-binding protein  40.74 
 
 		 294 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0231046  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1058  transcriptional regulator  40.74 
 
 		 294 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.758834  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1061  transcriptional regulator  40.74 
 
 		 294 aa  45.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000113559  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1080  DNA-binding protein  40.74 
 
 		 294 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5473  putative transcriptional regulator PlcR  25.51 
 
 		 285 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00043011  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2474  XRE family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 267 aa  43.9  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2570  hypothetical protein  20.7 
 
 		 430 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0258744  normal  0.5369 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4547  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 288 aa  43.1  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.732367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1693  XRE family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 289 aa  43.1  0.006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0267924  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0423  transcriptional regulator/TPR domain protein, putative  31.88 
 
 		 427 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0860  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 310 aa  42.7  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0471482 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>