16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1820 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1820  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 877 aa  1825    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1020  hypothetical protein  29.06 
 
 		 936 aa  318  3e-85  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00854238 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0763  TonB-dependent receptor  23.58 
 
 		 891 aa  173  1e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1552  TonB-dependent receptor HmuR  23.28 
 
 		 646 aa  60.5  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0509  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  24.53 
 
 		 614 aa  54.7  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.194967  normal  0.193806 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0781  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 		 757 aa  48.9  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.877086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0144  TonB-dependent receptor  30.72 
 
 		 756 aa  48.1  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.398028  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4329  TonB-dependent receptor  31.33 
 
 		 734 aa  47.8  0.0009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.692193  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  22.56 
 
 		 613 aa  46.6  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  25 
 
 		 638 aa  45.8  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01534  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  25.52 
 
 		 647 aa  46.2  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0349  TonB-dependent receptor  23.35 
 
 		 850 aa  45.1  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5290  TonB-dependent receptor plug  25.12 
 
 		 673 aa  44.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3783  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25 
 
 		 615 aa  44.7  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000781057  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4967  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 		 698 aa  44.7  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.655024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2030  TonB-dependent receptor, plug  26.11 
 
 		 668 aa  44.3  0.01  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>