30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0554 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0554  PASTA domain containing protein  100 
 
 		 203 aa  416  9.999999999999999e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0972959  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08001  hypothetical protein  46.82 
 
 		 206 aa  164  5.9999999999999996e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2619  PASTA domain-containing protein  42.02 
 
 		 205 aa  145  4.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1368  hypothetical protein  40.51 
 
 		 298 aa  121  7e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0294  PASTA domain containing protein  38.18 
 
 		 258 aa  106  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2925  PASTA domain containing protein  39.6 
 
 		 264 aa  101  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1846  PASTA domain containing protein  38.04 
 
 		 254 aa  97.8  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0407237  normal  0.022075 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0923  hypothetical protein  35.71 
 
 		 258 aa  93.2  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0499839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5945  PASTA domain containing protein  33.85 
 
 		 273 aa  85.9  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.637805  normal  0.0723251 
 
 
-
 
NC_002950  PG0731  hypothetical protein  30 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0178  PASTA domain containing protein  26.9 
 
 		 259 aa  68.2  0.00000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00052168  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0786  serine/threonine protein kinase, putative  24.06 
 
 		 666 aa  53.1  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  27.54 
 
 		 625 aa  49.3  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1196  PASTA  32 
 
 		 584 aa  48.1  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  31.25 
 
 		 692 aa  47.8  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  26.67 
 
 		 662 aa  47.8  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0667  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.77 
 
 		 652 aa  47.4  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0537547  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  33.59 
 
 		 604 aa  47.4  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  24.74 
 
 		 638 aa  46.6  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1279  protein kinase  27.2 
 
 		 664 aa  46.6  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1304  protein kinase  27.2 
 
 		 664 aa  46.6  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0019  serine/threonine protein kinase  26.81 
 
 		 582 aa  44.7  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0962  hypothetical protein  26.96 
 
 		 242 aa  44.3  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.915244  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  39.13 
 
 		 612 aa  43.9  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36 
 
 		 662 aa  43.9  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.458756 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.06 
 
 		 627 aa  42  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3920  helix-turn-helix, AraC type  29.47 
 
 		 367 aa  42  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.597723 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1337  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  25.85 
 
 		 646 aa  42  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00314134 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  31.19 
 
 		 612 aa  41.6  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  37.78 
 
 		 621 aa  41.6  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>