74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0813 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0813  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
109 aa  224  3e-58  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0244  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.13 
 
 
116 aa  66.2  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.250681 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0997  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.45 
 
 
109 aa  65.1  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.035917  hitchhiker  0.00920354 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0686  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  36.11 
 
 
109 aa  63.2  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5207  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.67 
 
 
171 aa  50.8  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.92121  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5415  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.1 
 
 
521 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.792379  normal  0.597511 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09350  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  30.12 
 
 
141 aa  47  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1911  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.43 
 
 
100 aa  47.4  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2821  Rieske (2Fe-2S) region  28.95 
 
 
102 aa  47  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1967  Rieske (2Fe-2S) region  30.43 
 
 
96 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0966264  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4025  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.84 
 
 
130 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0747  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.09 
 
 
136 aa  45.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1996  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.18 
 
 
100 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.664018  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1196  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.16 
 
 
289 aa  45.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4116  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.09 
 
 
130 aa  45.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.603301 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4687  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.17 
 
 
186 aa  45.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0466  Plastoquinol--plastocyanin reductase  31.87 
 
 
182 aa  45.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.434271  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2796  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  37.29 
 
 
108 aa  44.7  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.654028  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7008  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.33 
 
 
527 aa  44.7  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144463  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0662  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.94 
 
 
506 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0167  Rieske (2Fe-2S) region  34.21 
 
 
119 aa  43.9  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1875  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.56 
 
 
639 aa  43.9  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0135993 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0429  plastoquinol--plastocyanin reductase  36.76 
 
 
182 aa  43.5  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000311251  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09103  apoptosis-inducing factor (Eurofung)  31.51 
 
 
561 aa  43.5  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0266985  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1329  putative dioxygenase, ferredoxin reductase component  33.87 
 
 
521 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0248077 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0394  cytochrome b6-f complex, iron-sulfur subunit  33.85 
 
 
181 aa  43.5  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.582739  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4231  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.72 
 
 
105 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7180  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.5 
 
 
114 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.602112 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0311  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.25 
 
 
105 aa  42  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.021793 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0361  Plastoquinol--plastocyanin reductase  34.38 
 
 
181 aa  42.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000109538  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0716  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.33 
 
 
105 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.025133  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0236  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, ferredoxin subunit  35.94 
 
 
109 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2705  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, ferredoxin subunit  35.94 
 
 
109 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1577  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, ferredoxin subunit  35.94 
 
 
109 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.869936  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2561  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, ferredoxin subunit  35.94 
 
 
109 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0922  methanesulfonate monooxygenase component; iron sulfur protein  32.35 
 
 
242 aa  42.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.738029  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0205  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  35.94 
 
 
109 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1380  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, ferredoxin subunit  35.94 
 
 
109 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.186781  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0981  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  35.94 
 
 
109 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0490  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  31.08 
 
 
109 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1353  oxidoreductase  35.42 
 
 
521 aa  41.6  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5504  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.36 
 
 
108 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.124598  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1698  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.88 
 
 
640 aa  42  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3669  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.36 
 
 
108 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.738821 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3303  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.1 
 
 
103 aa  42  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0970  twin-arginine translocation pathway signal  31.67 
 
 
160 aa  42  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4955  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.36 
 
 
108 aa  41.6  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.519732  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1270  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.26 
 
 
106 aa  42  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.246103  hitchhiker  0.0000000754638 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0914  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.89 
 
 
518 aa  42  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0653376  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0991  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  32.39 
 
 
103 aa  41.2  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.220686  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0570  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.94 
 
 
506 aa  41.2  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0198905  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2392  protein of unknown function DUF59  33.33 
 
 
238 aa  41.2  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3982  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.84 
 
 
105 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0367029 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4586  Rieske (2Fe-2S) region  36.36 
 
 
108 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.312616  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2933  cytochrome b/b6 complex, iron-sulfur subunit  29.51 
 
 
131 aa  41.2  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1197  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.58 
 
 
130 aa  41.2  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0893  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.87 
 
 
106 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.203676  normal  0.227269 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4343  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.67 
 
 
155 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.36363  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3777  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.36 
 
 
108 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.872692  normal  0.412492 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2256  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.58 
 
 
643 aa  40.8  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.429922  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2323  Rieske (2Fe-2S) protein  36.36 
 
 
108 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3746  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.36 
 
 
108 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.108566  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1419  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  28.16 
 
 
179 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000338056  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1734  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  30.99 
 
 
178 aa  40.8  0.006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.847786  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0795  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.1 
 
 
105 aa  40.8  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1747  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.34 
 
 
642 aa  40.8  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1780  Plastoquinol--plastocyanin reductase  32.35 
 
 
181 aa  40.8  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00627342 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3205  nitrogen-fixing NifU-like  28.57 
 
 
311 aa  40.4  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0457  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.58 
 
 
130 aa  40.8  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0173  Rieske (2Fe-2S) region  32.18 
 
 
104 aa  40.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4105  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.53 
 
 
105 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1503  naphthalene 1,2-dioxygenase system ferredoxin component  32.93 
 
 
105 aa  40  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4570  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.53 
 
 
105 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0919723  hitchhiker  0.000210645 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1910  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25 
 
 
171 aa  40  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0215924  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>